42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3722 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3722  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 760 aa  1502    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44099  normal  0.232019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.23 
 
 		 487 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  31.17 
 
 		 482 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  29.46 
 
 		 482 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2270  cyclic nucleotide-binding protein  31.12 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  23.47 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.16 
 
 		 503 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.95 
 
 		 660 aa  55.1  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.15 
 
 		 649 aa  55.1  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.2 
 
 		 219 aa  51.6  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  27.95 
 
 		 601 aa  51.6  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2683  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.61 
 
 		 236 aa  51.2  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  37 
 
 		 606 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  37 
 
 		 606 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  29.75 
 
 		 923 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.2 
 
 		 650 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4045  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 260 aa  49.7  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.48 
 
 		 171 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  23.57 
 
 		 441 aa  48.9  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 238 aa  48.5  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  26.57 
 
 		 413 aa  48.5  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  25.42 
 
 		 625 aa  48.1  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.17 
 
 		 223 aa  47.8  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  24.83 
 
 		 811 aa  47  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.79 
 
 		 858 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  29.81 
 
 		 214 aa  46.6  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  27.5 
 
 		 357 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  33.72 
 
 		 227 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  31 
 
 		 772 aa  46.2  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0199  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 227 aa  45.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  28.21 
 
 		 639 aa  45.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 		 606 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  28.21 
 
 		 563 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  24.56 
 
 		 738 aa  45.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.21 
 
 		 408 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.93 
 
 		 234 aa  44.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  32.5 
 
 		 169 aa  44.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.35 
 
 		 649 aa  44.7  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 479 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 236 aa  44.3  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.09 
 
 		 220 aa  44.3  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.49 
 
 		 238 aa  44.3  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>