More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1565 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1565  Rhodanese domain protein  100 
 
 
275 aa  569  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  37.85 
 
 
272 aa  155  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  37.69 
 
 
270 aa  152  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  36.33 
 
 
273 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  37.73 
 
 
276 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  29.78 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
271 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  32.83 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  28.21 
 
 
276 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  29.41 
 
 
271 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  30.38 
 
 
613 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  29.07 
 
 
271 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  28.26 
 
 
269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  29.73 
 
 
610 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  30.07 
 
 
269 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  28.83 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  28.78 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  30.67 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  31.6 
 
 
290 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  29.09 
 
 
269 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.23 
 
 
285 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0501  rhodanese domain-containing protein  29.05 
 
 
285 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2817  Rhodanese domain protein  28.78 
 
 
325 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 
283 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  32.72 
 
 
291 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  28.51 
 
 
271 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  29.39 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  28.52 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  30.92 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  28.99 
 
 
281 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  28.15 
 
 
284 aa  96.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.8 
 
 
793 aa  96.3  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  28.38 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  29.32 
 
 
281 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 
307 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  30.89 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  32.1 
 
 
627 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  30.09 
 
 
321 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  28.19 
 
 
288 aa  92.8  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  30.09 
 
 
306 aa  92.8  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  29.96 
 
 
303 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  28.77 
 
 
297 aa  92.4  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  29.28 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1145  Rhodanese domain protein  31.39 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709325  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0931  putative rhodanese-like sulfur transferase  26.45 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186948  normal  0.41273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.98 
 
 
805 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  29.65 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  29.2 
 
 
282 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  30.54 
 
 
366 aa  90.1  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  24.06 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  30.13 
 
 
289 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  29.48 
 
 
284 aa  89  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  29.48 
 
 
284 aa  89  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  28.77 
 
 
310 aa  89  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  28.95 
 
 
279 aa  89  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  25.64 
 
 
295 aa  88.6  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  28.45 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  27.03 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  25.64 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  33.48 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  25.64 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  25.64 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  31.1 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0587  rhodanese domain-containing protein  26.75 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.287178  normal  0.0572789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  27.01 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2096  Rhodanese domain protein  30.47 
 
 
258 aa  87.8  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  31.02 
 
 
277 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  28.38 
 
 
277 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  29.13 
 
 
277 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2370  Rhodanese domain protein  32.87 
 
 
298 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000188451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  29.13 
 
 
277 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.1 
 
 
287 aa  85.5  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  27.59 
 
 
283 aa  85.5  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
327 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  28.73 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2805  rhodanese domain-containing protein  30.67 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  30.63 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  26.67 
 
 
477 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  26.88 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  25.64 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  26.29 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  29.82 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  29.82 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  29.82 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  27.07 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  28.31 
 
 
308 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  25.91 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  25.91 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  27.85 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  27.43 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  27.43 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  26.22 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  27.88 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  29.82 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  28.76 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  28.44 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  31.58 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  27.3 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>