More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1040 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1040  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 167 aa  342  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  39.39 
 
 		 107 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  39.39 
 
 		 107 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  39.39 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  39.39 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  43.9 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  41.57 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  37.25 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  36.78 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  35.35 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  34.15 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  34.48 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  38.37 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  37.8 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  44.05 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  35.11 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  39.08 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  39.08 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  39.02 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  37.93 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  33.33 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  36.96 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  32.11 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  33.01 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  36.46 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  35.42 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  36.96 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  38.37 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  34.48 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  36.96 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  36.96 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  36.96 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  36.96 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  39.13 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  36.96 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  35.42 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  35.05 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  36.59 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  36.96 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  35.42 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  39.33 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  39.33 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  39.02 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  38.46 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  38.89 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  36.96 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  38.46 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  35.05 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  32.61 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  35.87 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  32.35 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  34.78 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  30.84 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  37.21 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  33.7 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  31.31 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  33.7 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  36.67 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  36.67 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  38.82 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  36.84 
 
 		 115 aa  57.4  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  38.82 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  40 
 
 		 110 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  36.05 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  36.17 
 
 		 110 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  39.02 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  38.82 
 
 		 106 aa  57  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  38.82 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  34.78 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  32.63 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  34.04 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1139  Thioredoxin domain protein  36 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  32.93 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  38.57 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  36.47 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  32.32 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  36.08 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  34.31 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  37.08 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  34.38 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  38.2 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  34 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  36.59 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  30.93 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  36.59 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  32.98 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  34.78 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  34.74 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  36.05 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  36.47 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  36.84 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  37.21 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  34.02 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  34.48 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  35.11 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  32.61 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  32.99 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  36.78 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  32.99 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  34.48 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>