61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_R0009 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_R0009  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.940514  normal  0.189803 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0036  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0622774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0012  tRNA-Asn  88.33 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.571236  normal  0.0197692 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1570  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.736418  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0038  tRNA-Val  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835674  normal  0.174282 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_R0059  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.607028  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2130  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2208  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0019  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0099  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0501832  normal  0.522797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0098  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0062  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.669958  normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0409  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000026925  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0408  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000233964  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0407  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000764097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0034  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0028  tRNA-Ala  84.75 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.148209  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0090  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0007  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000068563  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0006  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0007  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 106 bp  46.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0399  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000357697  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0035  tRNA-Asn  93.55 
 
 		 106 bp  46.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60220  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4564  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0078  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000025771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0066  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0067  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0068  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.437414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0063  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.362704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0081  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0055  tRNA-Phe  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000546221  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0032  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0048  tRNA-Asn  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.667802  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0007  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00275012  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0054  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt44  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.305367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41330  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.908879  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t44  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0633005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA32  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.922886  normal  0.953507 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0015  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.905096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0036  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.212017  normal  0.456319 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0035    100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00887484  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R52  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R54  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0013  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00152659  hitchhiker  0.00055755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0035  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0451303  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0891  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0009  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.538917  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0048  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0040  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.262855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3503  tRNA-His  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3505  tRNA-His  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0033  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0587853  normal  0.374695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0042  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0047  tRNA-His  96.67 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.030582 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0019  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000545792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0485613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>