More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1121 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
239 aa  488  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  65.16 
 
 
278 aa  294  9e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  57.73 
 
 
238 aa  267  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  58.37 
 
 
246 aa  267  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  57.38 
 
 
238 aa  265  5.999999999999999e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  56.56 
 
 
249 aa  259  3e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 
247 aa  105  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
243 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  34.9 
 
 
233 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  29.55 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  29.55 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  40.13 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  31.02 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  30.24 
 
 
231 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  29.55 
 
 
244 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  35.19 
 
 
231 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  33.52 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  36.94 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  36.87 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  36.77 
 
 
248 aa  92  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  30.43 
 
 
240 aa  92  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  33.73 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  30.19 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  32.95 
 
 
232 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  36.27 
 
 
225 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  35.03 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  36.27 
 
 
225 aa  89  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  28.57 
 
 
241 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  35.38 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  35 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  32.99 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  30.34 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  31.76 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  28.64 
 
 
240 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  35.03 
 
 
243 aa  85.9  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  28.57 
 
 
242 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  39.44 
 
 
236 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  35.8 
 
 
241 aa  85.1  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  32.07 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  28.91 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  39.73 
 
 
518 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  29.56 
 
 
511 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  29.14 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  29.79 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  36.88 
 
 
532 aa  82  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  32.02 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  27.27 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  32.2 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  33.75 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  33.12 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  31.82 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  27.68 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  31.14 
 
 
521 aa  79.7  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  34.01 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  29.48 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  29.56 
 
 
243 aa  79  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  31.22 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  32.26 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  41.67 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1287  GMP synthase  36.43 
 
 
539 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0197854  normal  0.456639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  35.57 
 
 
238 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  29.48 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1522  GMP synthase  36.43 
 
 
539 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.403543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1292  GMP synthase  36.43 
 
 
539 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2546  GMP synthase  36.43 
 
 
547 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222873  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2402  GMP synthase  36.43 
 
 
539 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.630699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3290  GMP synthase  36.43 
 
 
539 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0624455  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2021  GMP synthase  36.43 
 
 
539 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2454  GMP synthase  36.43 
 
 
539 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3000  glutamine amidotransferase class-I  30.81 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372191  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  26.97 
 
 
511 aa  76.3  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2058  GMP synthase  35.71 
 
 
599 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  32.5 
 
 
516 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  30.91 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2009  GMP synthase  30.81 
 
 
539 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6088  GMP synthase  30.81 
 
 
539 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1891  GMP synthase  32.38 
 
 
539 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.888833  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  31.87 
 
 
516 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2022  GMP synthase  32.38 
 
 
539 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1989  GMP synthase  30.81 
 
 
539 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5299  GMP synthase  35.71 
 
 
539 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  32.09 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  29.19 
 
 
511 aa  75.5  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  29.82 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3013  GMP synthase  36.05 
 
 
540 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  27.37 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  30.6 
 
 
538 aa  75.1  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0009  GMP synthase  29.89 
 
 
536 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000958446 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1854  GMP synthase  30.98 
 
 
539 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  31.36 
 
 
531 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  29.81 
 
 
511 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0016  GMP synthase  30.43 
 
 
531 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0584814  normal  0.856164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  34.12 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  31.71 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  33.77 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  31.58 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1261  GMP synthase  31.07 
 
 
538 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>