More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2015 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2015  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
323 aa  617  1e-176  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1995  peptidase M48 Ste24p  46.6 
 
 
318 aa  205  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0373  peptidase M48 Ste24p  31.17 
 
 
275 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0941774  normal  0.226401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  32.72 
 
 
306 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  30.19 
 
 
296 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  32.45 
 
 
286 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  32.21 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  30.74 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0795  peptidase M48 Ste24p  29.74 
 
 
274 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  30.1 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  31.52 
 
 
288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3563  peptidase M48 Ste24p  29.62 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  30.04 
 
 
286 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  32.22 
 
 
283 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10573  heat shock protein HtpX  31.84 
 
 
286 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1567  M48 family peptidase  30.35 
 
 
286 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.601696  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  32.1 
 
 
285 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0579  peptidase M48 Ste24p  33.88 
 
 
314 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.912207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  31.35 
 
 
294 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  31.82 
 
 
296 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2252  heat shock protein HtpX  30.55 
 
 
297 aa  106  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  31.37 
 
 
285 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  31.7 
 
 
285 aa  105  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  31.8 
 
 
285 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  31.8 
 
 
285 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  32.59 
 
 
296 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  31.8 
 
 
285 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  31.8 
 
 
285 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  31.8 
 
 
285 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  31.8 
 
 
285 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  31.8 
 
 
285 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  30.53 
 
 
285 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0341  heat shock protein HtpX  28.72 
 
 
291 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.786483  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2745  peptidase M48 Ste24p  29.33 
 
 
269 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0732681  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  31.32 
 
 
285 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  31.32 
 
 
285 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  31.32 
 
 
285 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  31.46 
 
 
285 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  26.33 
 
 
312 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  29.48 
 
 
292 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1397  heat shock protein HtpX  26.6 
 
 
285 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.809815  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  29.58 
 
 
343 aa  103  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  29.55 
 
 
294 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0993  heat shock protein HtpX  29.39 
 
 
296 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.653344  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  32.46 
 
 
280 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  30.94 
 
 
285 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  28.62 
 
 
320 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0907  heat shock protein HtpX  29.15 
 
 
304 aa  102  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  32.72 
 
 
286 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
296 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  27.87 
 
 
320 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5252  heat shock protein HtpX  28.95 
 
 
292 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0767  heat shock protein HtpX  30.15 
 
 
291 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0626  heat shock protein HtpX  26.45 
 
 
284 aa  102  9e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 
285 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0772  heat shock protein HtpX  30.15 
 
 
291 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0550  peptidase M48, Ste24p  35.6 
 
 
320 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111224  hitchhiker  0.000685089 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0786  heat shock protein HtpX  30.15 
 
 
291 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790801  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  32.35 
 
 
286 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  28.73 
 
 
291 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  30.62 
 
 
280 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  31.99 
 
 
286 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0406  peptidase M48, Ste24p  30.74 
 
 
306 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1612  peptidase M48 Ste24p  29.69 
 
 
280 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.686402  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  31.75 
 
 
287 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  31.68 
 
 
307 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  31.48 
 
 
285 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0594  heat shock protein HtpX  27.48 
 
 
291 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.654376  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  31.48 
 
 
285 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0856  M48 family peptidase  27.8 
 
 
287 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000166966  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03400  Heat shock protein  31.48 
 
 
287 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1239  heat shock protein HtpX  25.73 
 
 
285 aa  99.8  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  27.84 
 
 
285 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0511  heat shock protein HtpX  25.73 
 
 
285 aa  99.4  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1103  peptidase M48 Ste24p  29.89 
 
 
292 aa  99  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  28.79 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1586  peptidase M48 Ste24p  30.04 
 
 
268 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.808778  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  27.76 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1156  HtpX-2 peptidase  28.19 
 
 
287 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000134347  normal  0.0135663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0855  heat shock protein HtpX  29.77 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  28.52 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2054  peptidase M48 Ste24p  29.04 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  29.81 
 
 
290 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  29.63 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0474  peptidase M48 Ste24p  29.96 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1307  heat shock protein HtpX  27.34 
 
 
292 aa  97.1  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.705744  normal  0.014146 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1791  peptidase M48 Ste24p  31.68 
 
 
308 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0855  heat shock protein HtpX  29.86 
 
 
293 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298753  hitchhiker  0.00154428 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  27 
 
 
281 aa  96.3  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  26.04 
 
 
279 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1255  heat shock protein HtpX  28.48 
 
 
294 aa  96.3  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  29.78 
 
 
300 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1090  heat shock protein HtpX  28.14 
 
 
321 aa  95.5  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0879  peptidase M48 Ste24p  29.77 
 
 
295 aa  95.9  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  31.62 
 
 
283 aa  95.9  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  29.78 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  26.17 
 
 
283 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0199  peptidase M48, Ste24p  31.8 
 
 
287 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1746  heat shock protein HtpX  28.14 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>