39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1783 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1783  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  62.99 
 
 		 250 aa  324  9e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  64.37 
 
 		 250 aa  323  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  63.41 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1001  hypothetical protein  65.32 
 
 		 249 aa  309  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  43.88 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  40.24 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0916  hypothetical protein  38.03 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.58478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  40.08 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  34.62 
 
 		 277 aa  148  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2938  hypothetical protein  37.19 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131158 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  36.93 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1643  exonuclease  31.49 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4364  hypothetical protein  40.08 
 
 		 301 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015731  normal  0.163667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4370  hypothetical protein  36.02 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4347  hypothetical protein  36.02 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4215  hypothetical protein  36.02 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105075  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  36.02 
 
 		 164 aa  112  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  38.46 
 
 		 165 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  37.82 
 
 		 162 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  37.82 
 
 		 165 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  36.91 
 
 		 168 aa  95.9  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2961  exonuclease-like protein  37.16 
 
 		 182 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0548295  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  37.84 
 
 		 168 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  37.16 
 
 		 168 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  29.21 
 
 		 423 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  26.49 
 
 		 414 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  39.44 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  36.51 
 
 		 550 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  31.09 
 
 		 290 aa  46.2  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  38.03 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  39.44 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0672  hypothetical protein  28.7 
 
 		 297 aa  45.4  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  27.03 
 
 		 382 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0517  hypothetical protein  27.15 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  25 
 
 		 381 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  25.56 
 
 		 361 aa  42.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  27.61 
 
 		 204 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>