More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1084 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1084  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  100 
 
 
442 aa  864    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1132  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  60.92 
 
 
437 aa  479  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303022  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3046  Phosphoglucosamine mutase  59.4 
 
 
445 aa  481  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1344  Phosphoglucosamine mutase  60.28 
 
 
446 aa  457  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2253  Phosphoglucosamine mutase  57.24 
 
 
434 aa  451  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329457  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.41 
 
 
433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  44.32 
 
 
434 aa  323  5e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  37.75 
 
 
450 aa  282  7.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  40.23 
 
 
419 aa  274  3e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  37.08 
 
 
452 aa  272  7e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  37.98 
 
 
458 aa  272  7e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  40.7 
 
 
430 aa  271  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  38.8 
 
 
455 aa  270  4e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  38.43 
 
 
448 aa  270  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.46 
 
 
447 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.95 
 
 
456 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  39.07 
 
 
430 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  40 
 
 
430 aa  263  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0330  phosphoglucosamine mutase  34.51 
 
 
437 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.256489  hitchhiker  0.00063167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0315  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.9 
 
 
418 aa  259  7e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.660935 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  34.19 
 
 
437 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.41 
 
 
418 aa  256  6e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0255  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  40.53 
 
 
416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2852  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.71 
 
 
419 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  35.92 
 
 
460 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0433  phosphoglucosamine mutase  34.82 
 
 
452 aa  252  1e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.732829  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  36.32 
 
 
453 aa  249  7e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  32.74 
 
 
446 aa  247  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  36.78 
 
 
454 aa  237  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  36.56 
 
 
480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0785  alpha-phosphoglucomutase / phosphomannomutase  36.65 
 
 
458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00879985  unclonable  0.000000000000213638 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  36.47 
 
 
416 aa  231  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  37.86 
 
 
454 aa  230  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.54 
 
 
452 aa  224  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  38.33 
 
 
454 aa  218  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1384  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  37.12 
 
 
454 aa  216  8e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  30.73 
 
 
455 aa  206  6e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2740  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.92 
 
 
445 aa  206  6e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0512  Phosphoglucosamine mutase  36.86 
 
 
460 aa  196  9e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  38.02 
 
 
452 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.75 
 
 
453 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  34.22 
 
 
450 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  32.81 
 
 
444 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  34.44 
 
 
451 aa  190  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  35.23 
 
 
450 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  33.55 
 
 
445 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1359  phosphoglucosamine mutase  32.4 
 
 
455 aa  188  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1006  phosphoglucosamine mutase  33.55 
 
 
455 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0191  phosphoglucosamine mutase  29.74 
 
 
453 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.13045  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01560  phosphoglucosamine mutase  33.26 
 
 
449 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1258  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.61 
 
 
418 aa  187  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  30.75 
 
 
449 aa  187  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0479  phosphoglucosamine mutase  31.66 
 
 
452 aa  187  4e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  33.04 
 
 
466 aa  187  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1260  phosphoglucosamine mutase  31.32 
 
 
451 aa  186  8e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000461219  normal  0.0582076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  33.71 
 
 
450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2186  phosphoglucosamine mutase  34.47 
 
 
447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1095  phosphoglucosamine mutase  32.51 
 
 
489 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100565  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  34.22 
 
 
449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  33.77 
 
 
450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2243  phosphoglucosamine mutase  33.11 
 
 
452 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.6083  normal  0.124274 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1316  Phosphoglucosamine mutase  32.73 
 
 
450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  33.48 
 
 
445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2193  phosphoglucosamine mutase  31.25 
 
 
451 aa  183  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.516388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1762  phosphoglucosamine mutase  31.41 
 
 
451 aa  183  6e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2231  phosphoglucosamine mutase  31.25 
 
 
451 aa  183  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.450292  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  31.3 
 
 
447 aa  183  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  34.72 
 
 
458 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  28.41 
 
 
478 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0945  phosphoglucosamine mutase  34.71 
 
 
461 aa  182  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  33.93 
 
 
451 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  32.25 
 
 
455 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  33.64 
 
 
446 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  34.29 
 
 
447 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  34.51 
 
 
447 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  28.7 
 
 
453 aa  180  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  33.41 
 
 
446 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1148  phosphoglucosamine mutase  33.9 
 
 
470 aa  179  8e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2168  phosphoglucosamine mutase  33.63 
 
 
447 aa  179  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  31.6 
 
 
449 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  31.15 
 
 
449 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  32.96 
 
 
448 aa  178  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1807  phosphoglucosamine mutase  29.46 
 
 
446 aa  178  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  32.08 
 
 
449 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  34.01 
 
 
447 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1567  phosphoglucosamine mutase  29.62 
 
 
445 aa  177  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  34.3 
 
 
447 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0810  phosphomannomutase  33.18 
 
 
447 aa  177  4e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  34.42 
 
 
454 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1127  Phosphoglucosamine mutase  34.3 
 
 
451 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  29.95 
 
 
458 aa  177  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  34.42 
 
 
454 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0616  phosphoglucosamine mutase  35.52 
 
 
455 aa  176  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.508325 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1152  phosphoglucosamine mutase  29.71 
 
 
448 aa  176  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00023632  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0187  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.34 
 
 
439 aa  176  9e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.117639  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  36.24 
 
 
456 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3769  phosphoglucosamine mutase  34.75 
 
 
490 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00158807  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  28.57 
 
 
475 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  31.53 
 
 
448 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2853  phosphoglucosamine mutase  33.86 
 
 
491 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>