More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2025 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  100 
 
 
322 aa  624  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  44.95 
 
 
321 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  44.81 
 
 
314 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  46.79 
 
 
313 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  45.34 
 
 
313 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  45.34 
 
 
317 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  45.89 
 
 
318 aa  229  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  44.59 
 
 
314 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  46.94 
 
 
312 aa  223  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  47.25 
 
 
319 aa  223  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  43.87 
 
 
314 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  43.87 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  44.05 
 
 
315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  43.41 
 
 
315 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  43.23 
 
 
314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  44.52 
 
 
316 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  43.37 
 
 
316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  42.99 
 
 
314 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  46.95 
 
 
316 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  42.3 
 
 
310 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  45.34 
 
 
329 aa  202  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  41.16 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  43.54 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  41.18 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  44.01 
 
 
315 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  39.48 
 
 
316 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  37.82 
 
 
317 aa  192  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  38.11 
 
 
325 aa  188  9e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  43.37 
 
 
320 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  42.39 
 
 
320 aa  175  9e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  44.68 
 
 
198 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
352 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  34.94 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  34.94 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  46.15 
 
 
194 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  47.67 
 
 
196 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  38.1 
 
 
212 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  46.6 
 
 
194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.57 
 
 
199 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  33.44 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  46.63 
 
 
194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  46.77 
 
 
209 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  46.77 
 
 
209 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  46.77 
 
 
209 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  46.77 
 
 
209 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  47.92 
 
 
196 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  47.92 
 
 
196 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  45.79 
 
 
194 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  46.27 
 
 
209 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  41.46 
 
 
129 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  39.84 
 
 
132 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  43.09 
 
 
134 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  39.84 
 
 
132 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  39.84 
 
 
132 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  42.19 
 
 
134 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  39.84 
 
 
130 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  41.41 
 
 
134 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  39.84 
 
 
130 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  44.8 
 
 
127 aa  105  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  39.84 
 
 
130 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  43.55 
 
 
129 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  39.52 
 
 
132 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  39.02 
 
 
130 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  38.21 
 
 
130 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1604  NUDIX hydrolase  27.72 
 
 
369 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  38.46 
 
 
134 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  47.37 
 
 
194 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  38.89 
 
 
129 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  47.37 
 
 
194 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  47.37 
 
 
194 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.65 
 
 
134 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.4 
 
 
132 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  37.7 
 
 
132 aa  99.4  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  36.59 
 
 
126 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  37.1 
 
 
133 aa  97.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  37.4 
 
 
131 aa  98.2  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1686  NUDIX hydrolase  26.84 
 
 
360 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.873349  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  43.55 
 
 
130 aa  96.7  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 
131 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1507  NUDIX hydrolase  28.9 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 
131 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  41.09 
 
 
142 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  34.96 
 
 
131 aa  92.8  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
142 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  41.09 
 
 
137 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.31 
 
 
360 aa  91.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  37.16 
 
 
213 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  36.59 
 
 
131 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.21 
 
 
218 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.35 
 
 
220 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  41.28 
 
 
128 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.02 
 
 
223 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004482  MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  38.52 
 
 
132 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  47.79 
 
 
142 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
142 aa  89.7  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.4 
 
 
134 aa  89.4  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.24 
 
 
213 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.79 
 
 
379 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.21 
 
 
128 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.21 
 
 
128 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>