More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0180 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 553 aa  1106    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2650  AMP-dependent synthetase and ligase  60 
 
 		 553 aa  621  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  48.58 
 
 		 607 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  47.04 
 
 		 584 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  48.98 
 
 		 584 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  47.93 
 
 		 588 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  49.63 
 
 		 585 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  47.97 
 
 		 588 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  49.45 
 
 		 588 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  47.97 
 
 		 588 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  47.75 
 
 		 587 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  46.18 
 
 		 576 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  48.45 
 
 		 588 aa  475  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  47.93 
 
 		 598 aa  472  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  47.9 
 
 		 598 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  45.24 
 
 		 592 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  48.48 
 
 		 602 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  40.56 
 
 		 568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  40.56 
 
 		 568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  40.11 
 
 		 571 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  40.11 
 
 		 571 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  39.43 
 
 		 572 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  40.14 
 
 		 572 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  39.43 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  39.43 
 
 		 572 aa  398  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  39.25 
 
 		 572 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  39.43 
 
 		 572 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  39.43 
 
 		 572 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  39.43 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  39.43 
 
 		 572 aa  398  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  39.43 
 
 		 572 aa  398  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  40.15 
 
 		 572 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  39.35 
 
 		 539 aa  362  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  38.1 
 
 		 625 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  37.08 
 
 		 629 aa  349  9e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  37.56 
 
 		 632 aa  346  7e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  36.31 
 
 		 629 aa  344  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  37.2 
 
 		 635 aa  340  4e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  35.15 
 
 		 631 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  36.61 
 
 		 632 aa  333  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  34.74 
 
 		 626 aa  332  9e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  37.29 
 
 		 629 aa  330  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  35.83 
 
 		 631 aa  331  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  35.75 
 
 		 629 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 560 aa  323  6e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 567 aa  317  4e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  36.36 
 
 		 661 aa  312  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  36.5 
 
 		 667 aa  310  4e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  35.23 
 
 		 661 aa  310  5e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  33.88 
 
 		 652 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  34.24 
 
 		 652 aa  303  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  33.52 
 
 		 652 aa  301  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  36 
 
 		 661 aa  299  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  32.51 
 
 		 657 aa  298  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  34.31 
 
 		 631 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  35.12 
 
 		 654 aa  298  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  33.52 
 
 		 638 aa  298  2e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  33.81 
 
 		 653 aa  297  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  33.51 
 
 		 649 aa  297  3e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  31.99 
 
 		 667 aa  297  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  35.8 
 
 		 655 aa  296  5e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  32.8 
 
 		 660 aa  296  7e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  34.5 
 
 		 632 aa  295  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  33.7 
 
 		 664 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  35.1 
 
 		 648 aa  295  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  33.57 
 
 		 632 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  33.39 
 
 		 632 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  33.76 
 
 		 670 aa  295  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  34.49 
 
 		 656 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  33.57 
 
 		 631 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  34.04 
 
 		 645 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  35.05 
 
 		 644 aa  293  5e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  34.3 
 
 		 638 aa  293  5e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  33.03 
 
 		 650 aa  293  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  31.96 
 
 		 660 aa  293  6e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  33.8 
 
 		 646 aa  293  7e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  34.64 
 
 		 667 aa  293  7e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4670  acetyl-CoA synthetase  34.38 
 
 		 652 aa  293  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  34.69 
 
 		 649 aa  293  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4535  acetyl-CoA synthetase  34.38 
 
 		 652 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4621  acetyl-CoA synthetase  34.38 
 
 		 652 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4619  acetyl-CoA synthetase  34.38 
 
 		 652 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.341691  normal  0.539786 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  32.97 
 
 		 658 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  33.75 
 
 		 666 aa  292  1e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  34.21 
 
 		 652 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  33.52 
 
 		 664 aa  291  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 552 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  32.5 
 
 		 650 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  34.21 
 
 		 652 aa  291  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03901  hypothetical protein  34.21 
 
 		 652 aa  291  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3958  acetyl-CoA synthetase  34.21 
 
 		 652 aa  291  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  34.21 
 
 		 652 aa  291  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 		 547 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  34.21 
 
 		 652 aa  291  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1527  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 		 633 aa  291  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.369396  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  34.47 
 
 		 650 aa  291  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  32.08 
 
 		 660 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4528  acetyl-CoA synthetase  34.21 
 
 		 652 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  34.6 
 
 		 656 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  33.51 
 
 		 664 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>