83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3534 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3534  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
308 aa  632  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  27.51 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.5 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.38 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  32.45 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  32.24 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  26.69 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.19 
 
 
293 aa  63.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  22.42 
 
 
291 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0661  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.1 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0888578  hitchhiker  0.00380684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.68 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.64 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.62 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.94 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
299 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.8 
 
 
317 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.58 
 
 
310 aa  56.6  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.62 
 
 
303 aa  56.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.05 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  35.82 
 
 
314 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1236  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.63 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.86 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.64 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.78 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2275  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.46 
 
 
293 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.547886  normal  0.134069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  33.33 
 
 
342 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.32 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0189  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.57 
 
 
280 aa  53.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.87 
 
 
306 aa  53.1  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.64 
 
 
307 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.64 
 
 
307 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.64 
 
 
307 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2871  hypothetical protein  21.77 
 
 
280 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.71 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.93 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35100  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.18 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1696  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.33 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364618  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0894  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.06 
 
 
293 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3013  hypothetical protein  21.81 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2638  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.52 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.202848  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2290  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.14 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3346  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.08 
 
 
305 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.08 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  27 
 
 
293 aa  49.3  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.98 
 
 
324 aa  49.7  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.14 
 
 
302 aa  49.7  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.88 
 
 
306 aa  49.3  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  23.08 
 
 
278 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2219  putative lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.06 
 
 
293 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2123  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.12 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.1 
 
 
404 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02482  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.77 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.03 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.32 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.11 
 
 
284 aa  46.6  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3871  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.87 
 
 
310 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3603  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  22.67 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.59 
 
 
319 aa  46.2  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  27.4 
 
 
307 aa  45.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  22.58 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.4 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1614  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.34 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2522  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.86 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3120  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.5 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.15 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5603  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.9 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.897415 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.68 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.53 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1883  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.71 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4302  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.15 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0281  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  23.29 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3251  putative acyltransferase  30.96 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  26.09 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.91 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3838  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.56 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22050  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.11 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748215  hitchhiker  0.000000000000001019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1946  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.55 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2628  Lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.72 
 
 
306 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4171  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.64 
 
 
325 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0205  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.89 
 
 
308 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176413  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1363  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.69 
 
 
292 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.698598  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0127  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.71 
 
 
289 aa  42.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0308089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  32.09 
 
 
310 aa  42.4  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>