More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1191 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1191  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
205 aa  412  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.015621  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0756  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.28 
 
 
202 aa  190  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2099  hypothetical protein  35.1 
 
 
199 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1893  hypothetical protein  35.1 
 
 
199 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0021  hypothetical protein  35.1 
 
 
199 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0526  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.84 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.69444  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2000  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.82 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  33.88 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0889  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.65 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1573  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.18 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2481  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30 
 
 
245 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.57969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3099  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.76 
 
 
187 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0393  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.9 
 
 
242 aa  58.9  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.19159  normal  0.171369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.05 
 
 
296 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.89109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 
302 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.428938  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  37.5 
 
 
297 aa  58.2  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2646  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.76 
 
 
306 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00933596  normal  0.124332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  34.45 
 
 
324 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0568  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.94 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.842156  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.61 
 
 
334 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  33.61 
 
 
324 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  29.91 
 
 
313 aa  56.2  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  36.11 
 
 
306 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4596  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.21 
 
 
302 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114387  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  31.3 
 
 
344 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4563  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.21 
 
 
313 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0563  thioredoxin reductase  30.83 
 
 
326 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0552475  normal  0.0148693 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  34.26 
 
 
306 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  37.82 
 
 
313 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  33.87 
 
 
320 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  28.7 
 
 
308 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  31.03 
 
 
340 aa  54.3  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  34.91 
 
 
306 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  32.77 
 
 
326 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  34.19 
 
 
322 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1396  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.97 
 
 
335 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.218522 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  36.21 
 
 
316 aa  53.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  32.77 
 
 
324 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  28.91 
 
 
353 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2606  Thioredoxin-disulfide reductase  33.9 
 
 
309 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  31.2 
 
 
361 aa  53.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  31.4 
 
 
311 aa  52.8  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  30 
 
 
324 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2572  alkyl hydroperoxide reductase, F52a subunit  28.57 
 
 
302 aa  52.4  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.533153  normal  0.726877 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18300  thioredoxin reductase  32.52 
 
 
303 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  29.17 
 
 
325 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3434  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.31 
 
 
302 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0828133  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  31.4 
 
 
361 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  30 
 
 
324 aa  52  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.62 
 
 
556 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  27.59 
 
 
313 aa  51.6  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  29.17 
 
 
325 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  31.4 
 
 
311 aa  52  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  30.51 
 
 
309 aa  51.6  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  32.79 
 
 
311 aa  51.6  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  29.06 
 
 
331 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.04 
 
 
197 aa  51.6  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.417007  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  33.06 
 
 
311 aa  51.6  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  26.98 
 
 
330 aa  51.6  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.29 
 
 
316 aa  50.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0737  thioredoxin reductase family protein  30.25 
 
 
306 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1047  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.08 
 
 
348 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  31.62 
 
 
324 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  31.93 
 
 
338 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  28.21 
 
 
329 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  29.17 
 
 
324 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0360  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.86 
 
 
291 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000662719  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  30.51 
 
 
326 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  29.06 
 
 
311 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2008  thioredoxin reductase  27.4 
 
 
306 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.141519 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0981  thioredoxin-disulfide reductase  31.2 
 
 
317 aa  50.8  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.708131  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.51 
 
 
318 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  31.36 
 
 
312 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.03 
 
 
306 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  30.16 
 
 
332 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  23.48 
 
 
339 aa  49.7  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4356  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.08 
 
 
568 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf510  thioredoxin reductase  31.71 
 
 
302 aa  49.7  0.00003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  27.35 
 
 
327 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.51 
 
 
318 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  27.19 
 
 
318 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.16 
 
 
342 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.2 
 
 
299 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  25.62 
 
 
314 aa  49.3  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.76 
 
 
318 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  32.79 
 
 
311 aa  48.9  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2581  thioredoxin reductase  30.08 
 
 
303 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230043  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  28.81 
 
 
335 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2768  thioredoxin reductase  30.08 
 
 
301 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.947222  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3793  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.3 
 
 
305 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0012  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.9 
 
 
299 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  30.58 
 
 
321 aa  48.9  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  30.58 
 
 
327 aa  48.9  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  27.12 
 
 
333 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  29.57 
 
 
318 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  27.12 
 
 
333 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  27.12 
 
 
333 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0834  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.25 
 
 
306 aa  48.5  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  30.25 
 
 
320 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4421  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.08 
 
 
572 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>