More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0543 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 456 aa  897    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  60.22 
 
 		 458 aa  520  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  46 
 
 		 476 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  43.32 
 
 		 476 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  45.36 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  42.67 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  43.7 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  43.7 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  43.1 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  43.48 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  43.48 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  38.24 
 
 		 489 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  42.92 
 
 		 506 aa  363  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  41.99 
 
 		 466 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  43.53 
 
 		 465 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  43.97 
 
 		 469 aa  358  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  44.12 
 
 		 488 aa  355  8.999999999999999e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  42.21 
 
 		 483 aa  353  2e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  42.95 
 
 		 467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  42.95 
 
 		 467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  42.18 
 
 		 465 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  42.42 
 
 		 467 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  42.95 
 
 		 467 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  42.42 
 
 		 467 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  42.42 
 
 		 467 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  42.73 
 
 		 467 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  42.64 
 
 		 467 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  42.73 
 
 		 467 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  41.74 
 
 		 490 aa  350  3e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  42.73 
 
 		 467 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  42.21 
 
 		 467 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  42.21 
 
 		 467 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  42.21 
 
 		 467 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  42.21 
 
 		 467 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  42.73 
 
 		 467 aa  348  9e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  41.52 
 
 		 496 aa  348  9e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  41.38 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  41.89 
 
 		 482 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  40.91 
 
 		 471 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  43.17 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  41.56 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  41.56 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  41.56 
 
 		 468 aa  347  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  41.56 
 
 		 468 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  40.74 
 
 		 471 aa  346  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  40.74 
 
 		 471 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  40.74 
 
 		 471 aa  346  5e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  40.74 
 
 		 471 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  41.63 
 
 		 466 aa  346  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  40.74 
 
 		 471 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  40.74 
 
 		 471 aa  346  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  40.74 
 
 		 471 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  40.26 
 
 		 471 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  41.81 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  41.81 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  42.51 
 
 		 467 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  42.95 
 
 		 467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  39.52 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  42.38 
 
 		 503 aa  342  5.999999999999999e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  41.94 
 
 		 463 aa  342  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  39.15 
 
 		 500 aa  342  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  40.36 
 
 		 496 aa  340  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  41.03 
 
 		 468 aa  341  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  41.52 
 
 		 463 aa  339  5e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  39.96 
 
 		 471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  44.1 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  39.96 
 
 		 471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  39.96 
 
 		 471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  38.29 
 
 		 495 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  38.95 
 
 		 486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  41.99 
 
 		 517 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  40.43 
 
 		 471 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  39.2 
 
 		 549 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  44.39 
 
 		 481 aa  334  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  40.4 
 
 		 518 aa  332  6e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  40.13 
 
 		 462 aa  332  6e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  37.76 
 
 		 496 aa  332  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  39.87 
 
 		 463 aa  332  8e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  39.67 
 
 		 494 aa  332  8e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  37.76 
 
 		 496 aa  332  8e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  41.3 
 
 		 491 aa  332  9e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  40.6 
 
 		 501 aa  331  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  39.87 
 
 		 463 aa  331  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  38.83 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  38.83 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  41.36 
 
 		 486 aa  328  9e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  39.51 
 
 		 495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  38.19 
 
 		 492 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  40.35 
 
 		 467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  40.53 
 
 		 495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  40.91 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  41.88 
 
 		 489 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  37.93 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  39.35 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  39.13 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  39.57 
 
 		 471 aa  323  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  37.68 
 
 		 525 aa  323  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  39.13 
 
 		 471 aa  322  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  40.63 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  39.29 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>