36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1770 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  229  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.24 
 
 		 87 aa  87.8  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  46.43 
 
 		 86 aa  72  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  42.86 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1510  putative virulence-associated protein  43.18 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0152  SpoVT/AbrB-like protein  41.11 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.887256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3379  SpoVT/AbrB-like  38.1 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  40.48 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  44.29 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  35.94 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  37.93 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  38.75 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  40.74 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  30.77 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1432  virulence-associated protein  37.5 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  35.29 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  33.33 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  35.38 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.18 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  34.43 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0748  hypothetical protein  32.79 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  41.79 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  41.86 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  34.38 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  31.58 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  47.22 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  48.72 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  30.86 
 
 		 79 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  32.86 
 
 		 87 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  33.93 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  39.53 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3758  SpoVT/AbrB-like protein  34.15 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067514  normal  0.0222413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  38.64 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  34.48 
 
 		 79 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  34.48 
 
 		 79 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>