More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0774 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
273 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  45.69 
 
 
273 aa  249  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2847  phosphotransferase  45.69 
 
 
273 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  45.69 
 
 
273 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1306  phosphotransferase  46.07 
 
 
274 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2879  phosphotransferase  43.45 
 
 
273 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1180  phosphotransferase  43.45 
 
 
273 aa  241  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  44.28 
 
 
273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  44.65 
 
 
273 aa  235  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0120  Cof-like hydrolase  45.72 
 
 
274 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0911  phosphotransferase  42.52 
 
 
286 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0848  phosphotransferase  42.52 
 
 
286 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.457335  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0820  phosphotransferase  42.52 
 
 
286 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0934  phosphotransferase  42.52 
 
 
286 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.600795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0879  phosphotransferase  42.52 
 
 
286 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0789  phosphotransferase  42.91 
 
 
272 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0793  phosphotransferase  42.91 
 
 
272 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  42.91 
 
 
272 aa  222  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0869  phosphotransferase  42.91 
 
 
306 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0687  phosphotransferase  42.52 
 
 
272 aa  223  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.028657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2876  Cof-like hydrolase  42.91 
 
 
272 aa  222  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2896  phosphotransferase  42.91 
 
 
272 aa  222  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0306419  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0820  phosphotransferase  42.91 
 
 
272 aa  222  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0986  hypothetical protein  40.22 
 
 
273 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4220  putative hydrolase  37.08 
 
 
244 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4241  hydrolase, Cof family  36.3 
 
 
244 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4398  Cof family hydrolase  36.7 
 
 
244 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  28.06 
 
 
274 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  29.2 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  30.43 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  28.15 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  29.04 
 
 
267 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  26.51 
 
 
279 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  29.96 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2024  Cof-like hydrolase  29.64 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4946  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  25.86 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  28.16 
 
 
273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  30.18 
 
 
271 aa  119  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  30.58 
 
 
273 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  29.03 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  25.74 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.03 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  27.34 
 
 
276 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  26.52 
 
 
277 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2883  Cof-like hydrolase  28.93 
 
 
282 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  27.14 
 
 
276 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  31.46 
 
 
273 aa  112  9e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  28.1 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  29.6 
 
 
268 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  28.25 
 
 
278 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  28.46 
 
 
269 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.45 
 
 
269 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  29.3 
 
 
269 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.45 
 
 
269 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  27.08 
 
 
274 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  27.08 
 
 
274 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  29.2 
 
 
269 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  30.74 
 
 
262 aa  105  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  27.78 
 
 
269 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  27.78 
 
 
269 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  27.78 
 
 
269 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  27.78 
 
 
269 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.78 
 
 
269 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.78 
 
 
269 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  27.78 
 
 
269 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  28.83 
 
 
272 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  29 
 
 
266 aa  102  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1298  HAD superfamily hydrolase  30.36 
 
 
286 aa  102  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000863241  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  27.54 
 
 
268 aa  102  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  26.5 
 
 
279 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  29.85 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  28.26 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  27.74 
 
 
269 aa  98.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4036  Cof protein  27.44 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  25.46 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  26.28 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  27.01 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  24.36 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  24.82 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  25.93 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  29.78 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  27.31 
 
 
273 aa  96.3  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  25.72 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.17 
 
 
269 aa  95.5  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  26.57 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2434  Cof protein  26.95 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  26.32 
 
 
270 aa  94  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0247  HAD superfamily hydrolase  24.64 
 
 
270 aa  94  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1830  Cof-like hydrolase  29.32 
 
 
260 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  30.15 
 
 
284 aa  94  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  25.9 
 
 
267 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1689  Cof family protein  29.96 
 
 
461 aa  93.2  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00487865  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  26.71 
 
 
268 aa  92.8  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  26.13 
 
 
277 aa  92.4  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  27.72 
 
 
271 aa  92.4  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2067  hydrolase  30.22 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.347224  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.69 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  25.71 
 
 
285 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  25.18 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  28.67 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>