200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0443 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0443  ParA-like protein  100 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.190603  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.35 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.83 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  27.15 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.73 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.27 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  20.83 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  21.76 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0439  hypothetical protein  56.6 
 
 		 77 aa  67  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.38 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.38 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.36 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.89 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  25.33 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  23.29 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  29.22 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.29 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  21.46 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  24.22 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  24.42 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  29.14 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3331  hypothetical protein  25.6 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  23.66 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  23.66 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1295  hypothetical protein  24.27 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1107  hypothetical protein  24.4 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  26.34 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  24.77 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.25 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.25 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2866  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.25 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.25 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2373  hypothetical protein  23.65 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.714384  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.25 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.47 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.25 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.25 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1281  hypothetical protein  25.26 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  24.07 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1215  hypothetical protein  23.83 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769269 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03280  parA family protein  29.01 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.71 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  27.7 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1422  hypothetical protein  22.71 
 
 		 247 aa  52  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.85 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.75 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3004  hypothetical protein  23.44 
 
 		 285 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  28.93 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  25.45 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0821  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.53 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.051634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1535  hypothetical protein  24.1 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.295146 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  30.33 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.87 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.23 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.06 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1214  hypothetical protein  23.19 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1285  hypothetical protein  23.19 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0462071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.63 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D24  ATPase for chromosome partitioning  27 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0126425  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0207  parA family protein  30.3 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.31 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  25.79 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3162  hypothetical protein  22.97 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  25.79 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1552  hypothetical protein  25 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2658  hypothetical protein  25.74 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3019  hypothetical protein  22.97 
 
 		 280 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.74 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.03 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.23 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.03 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.23 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.68 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.23 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1359  hypothetical protein  22.97 
 
 		 280 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000528372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.09 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.03 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.35 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  29.91 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.23 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.23 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.21 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.97 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.97 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.33 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.25 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.56 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.1 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  30.77 
 
 		 331 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  30.77 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.03 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.05 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  30.77 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  25.22 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>