67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0056 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  100 
 
 		 100 aa  206  9e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2128  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.25 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.254894  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01475  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  56.25 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01486  hypothetical protein  56.25 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2131  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  56.25 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.840351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2140  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  56.25 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1654  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  56.25 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  52.08 
 
 		 109 aa  120  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  52.08 
 
 		 97 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  52.08 
 
 		 97 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  52.08 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  55.21 
 
 		 96 aa  120  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  52.08 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  53.12 
 
 		 96 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  53.12 
 
 		 96 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  53.12 
 
 		 96 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  52.58 
 
 		 97 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  51.04 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  45.26 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.26 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  32.26 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_8324  predicted protein  35.29 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.06 
 
 		 95 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.08 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.19 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  26.83 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  31.46 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.58 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.1 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  27.4 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  27.4 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  25.61 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  26.67 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  25.61 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  24.18 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.51 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  25.61 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55140  hypothetical protein  34.15 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000327578 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  31.51 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.23 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.94 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 99 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  25.61 
 
 		 97 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  29.03 
 
 		 95 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  25.61 
 
 		 97 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  29.03 
 
 		 95 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  25.61 
 
 		 97 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 		 95 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.93 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.29 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4551  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  35.06 
 
 		 96 aa  40  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.05 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39960  hypothetical protein  25.35 
 
 		 254 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228774  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.24 
 
 		 96 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>