223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4017 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  273  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1614  CoA-binding protein  74.81 
 
 		 134 aa  209  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  71.76 
 
 		 134 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  68.18 
 
 		 132 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3507  CoA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  61.83 
 
 		 134 aa  179  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  57.25 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  56.82 
 
 		 133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  42.4 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  38.4 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  37.19 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  33.61 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  36.28 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  32.79 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3494  CoA-binding domain-containing protein  34.75 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.965482  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  31.97 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  39.77 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06185  conserved hypothetical protein  33.88 
 
 		 493 aa  73.9  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0429141 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  36.97 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0995  CoA-binding protein  32.28 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55314  predicted protein  29.53 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0728  CoA-binding domain-containing protein  35.2 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.298785 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  33.06 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1056  CoA-binding domain protein  31.5 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1284  CoA-binding domain-containing protein  28.93 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  36.36 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  32.54 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  34.71 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0985  CoA-binding domain protein  30.53 
 
 		 152 aa  67  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  30.97 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  34.55 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3341  CoA-binding domain-containing protein  31.2 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  34.55 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  31.2 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1164  CoA-binding domain protein  29.63 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  30.95 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  26.83 
 
 		 537 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  33.62 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1052  CoA-binding domain protein  29.92 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  26.09 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1548  hypothetical protein  29.6 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16153  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  27.43 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  31.93 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0982  CoA-binding domain-containing protein  32.79 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.419448 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  28.33 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  28.83 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  30.83 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  30.36 
 
 		 128 aa  57  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  30.1 
 
 		 669 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  29.2 
 
 		 176 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  29.92 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  31.9 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  30 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  26.55 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  29.63 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  29.63 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  29.63 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  29.63 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  29.63 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  25 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  30.53 
 
 		 695 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  29.63 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  29.63 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  29.47 
 
 		 697 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  30.85 
 
 		 711 aa  54.3  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  25.4 
 
 		 701 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  26.72 
 
 		 707 aa  53.9  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  30.17 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  28.8 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  29.37 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  30.33 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  28.7 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  25.36 
 
 		 692 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  29.6 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.26 
 
 		 696 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  32.76 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1388  CoA-binding domain-containing protein  28.3 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555595  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0846  CoA-binding domain-containing protein  22.61 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1309  CoA-binding domain-containing protein  32.32 
 
 		 705 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000175905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  28.8 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  28.8 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4825  CoA-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  28.8 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  29.09 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  32.61 
 
 		 697 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  29.17 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  28 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  28 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0566  CoA-binding  33.33 
 
 		 688 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.9879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2559  CoA-binding domain protein  30.4 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 706 aa  50.8  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>