31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3206 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  206  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  54.64 
 
 		 97 aa  115  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2634  hypothetical protein  58.76 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.27845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2271  hypothetical protein  52.63 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08920  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.354613  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  54.17 
 
 		 99 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1995  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1315  hypothetical protein  41.49 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.155217  normal  0.852602 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  32.95 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  32.22 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  29.7 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  25 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  29.47 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  31.4 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4021  plasmid stabilization system protein  29.03 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  29.63 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2895  hypothetical protein  40.74 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1752  hypothetical protein  24.74 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1104  hypothetical protein  26.09 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0352  plasmid stabilization system protein  26.53 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0252  hypothetical protein  25.29 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4658  hypothetical protein  30.93 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000145123  unclonable  0.0000000000000112336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  24.74 
 
 		 98 aa  42.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1938  plasmid stabilization system protein  36.9 
 
 		 97 aa  42  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2399  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00225312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4758  plasmid stabilization system  22.99 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0119344  hitchhiker  0.00000000435584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0273  hypothetical protein  27.84 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1130  hypothetical protein  27.16 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1705  plasmid stabilization system  26.67 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1322  hypothetical protein  23.4 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000305152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1113  plasmid stabilization system  26.32 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>