More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2865 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2865  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
345 aa  709    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000384977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0919  glycosyl transferase family protein  48.84 
 
 
355 aa  362  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00244033  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1711  glycosyl transferase family 2  47.95 
 
 
337 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9788799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2508  glycosyl transferase family 2  47.66 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000796473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2088  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.32 
 
 
384 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3593  glycosyl transferase family protein  35.91 
 
 
346 aa  209  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00282179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0979  glycosyl transferase family 2  35.67 
 
 
341 aa  193  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000658862  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
785 aa  89.7  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
1256 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
1435 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 
994 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
1600 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 
703 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
680 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
1523 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
1162 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.95 
 
 
427 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
1268 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  24.6 
 
 
860 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.38 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  22.44 
 
 
902 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
1077 aa  67  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
280 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
1739 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.51 
 
 
2401 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  21.13 
 
 
777 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
1523 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  25.2 
 
 
700 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
334 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
270 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0278  glycosyl transferase family 2  22.18 
 
 
576 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.859999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  24.15 
 
 
358 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
1188 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
430 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  25.51 
 
 
1444 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  24.07 
 
 
723 aa  60.1  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
1106 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  21.72 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  25.11 
 
 
320 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
624 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
528 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 
305 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 
350 aa  57  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
227 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  23.04 
 
 
336 aa  56.2  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  25.75 
 
 
1644 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  25.75 
 
 
1644 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
290 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
1340 aa  55.8  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 
1317 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  27.43 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.14 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  20.73 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 
1486 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1650  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
679 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.27 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
1152 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  20.07 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3221  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
328 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
289 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.58 
 
 
968 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
968 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
487 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
277 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 
1312 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
308 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
679 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 
299 aa  53.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  21.49 
 
 
1119 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
384 aa  53.1  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  25.22 
 
 
321 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.96 
 
 
322 aa  53.1  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
841 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
297 aa  53.1  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
1287 aa  52.8  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  23.36 
 
 
292 aa  52.8  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
305 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1747  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
352 aa  52.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.94845  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 
355 aa  52.8  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  28.44 
 
 
325 aa  52.8  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  28.16 
 
 
247 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
625 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
525 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2262  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
411 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>