298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2847 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2847  Gluconate transporter  100 
 
 		 447 aa  854    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1192  Gluconate transporter  57.11 
 
 		 476 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.423726  normal  0.434711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0190  Gluconate transporter  39.08 
 
 		 481 aa  293  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  30.37 
 
 		 460 aa  154  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1715  Gluconate transporter  45.16 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245438  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4026  permease DsdX  31.14 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  31.22 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4189  permease DsdX  31.14 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4010  permease DsdX  31.14 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02275  predicted transporter  31.22 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  31.22 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02236  hypothetical protein  31.22 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0217  gluconate transporter  28.05 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1304  permease DsdX  31.22 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.478606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2502  permease DsdX  31.22 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.667372  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4131  permease DsdX  31.14 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0918369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4081  permease DsdX  31.14 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  29.93 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0267  gluconate transporter  28.89 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2578  gluconate transporter  27.77 
 
 		 453 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840418  hitchhiker  0.000373663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2450  permease DsdX  30.93 
 
 		 445 aa  143  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0360  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  27.98 
 
 		 453 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3438  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  27.98 
 
 		 453 aa  143  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2629  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  27.98 
 
 		 453 aa  143  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00621588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2444  gluconate permease, putative  27.98 
 
 		 446 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1218  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  27.98 
 
 		 446 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3440  GntP family high-affinity gluconate permease  28.17 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3404  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  28.17 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1717  permease DsdX  30.07 
 
 		 445 aa  141  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.761378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4105  high-affinity gluconate transporter GntT  27.23 
 
 		 438 aa  139  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0135  gluconate transporter  27.23 
 
 		 438 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4021  high-affinity gluconate transporter GntT  27.23 
 
 		 438 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  29.66 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1219  gluconate permease, putative  27.53 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  29.98 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3703  gluconate transporter  28.15 
 
 		 448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.900144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0207  gluconate permease  27.82 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0156  gluconate permease  27.82 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4746  Gnt-II system L-idonate transporter  27.39 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04095  hypothetical protein  27.39 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04131  L-idonate and D-gluconate transporter  27.39 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3732  gluconate transporter  27.39 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4521  Gnt-II system L-idonate transporter  27.39 
 
 		 439 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00247449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0591  Na+/gluconate symporter, GntP  26.87 
 
 		 465 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0185  gluconate permease  27.82 
 
 		 448 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0165  gluconate permease  27.82 
 
 		 448 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0158  gluconate permease  27.82 
 
 		 448 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0163  gluconate permease  27.82 
 
 		 448 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3368  gluconate transporter  27.21 
 
 		 465 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.427288  hitchhiker  0.000000248851 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1189  high-affinity gluconate transporter (GNT-III system) transmembrane protein  26.85 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.585222  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  29.27 
 
 		 446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  26.61 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  26.61 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1410  Gluconate transporter  31.07 
 
 		 488 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0496328  normal  0.759951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0179  gluconate transporter  26.13 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0662  gluconate transporter  26.13 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0629  gluconate transporter  26.13 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3069  gluconate transporter  29.54 
 
 		 467 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.384324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4737  transporter gluconate:H+ symporter (GntP) family  28.12 
 
 		 439 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4867  gluconate:H+ symporter family protein  28.12 
 
 		 463 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.147551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4767  transporter, gluconate:H+ symporter (GntP) family  28.12 
 
 		 439 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0776084  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4830  gluconate:H+ symporter (hypothetical protein) family transporter  28.12 
 
 		 463 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.742324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  30.63 
 
 		 452 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4886  gluconate:H+ symporter family transporter  28.12 
 
 		 439 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  25.84 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2721  gluconate transporter  26.57 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3450  permease DsdX  28.7 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  29.6 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  29.6 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  29.6 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  29.6 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  29.6 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  29.72 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3748  gluconate transporter  26.13 
 
 		 453 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  27.23 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  29.41 
 
 		 447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0223  gluconate transporter  26.68 
 
 		 439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  27.38 
 
 		 461 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  25.45 
 
 		 453 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4651  gluconate transporter  27.71 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  27.18 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  29.72 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  27.21 
 
 		 462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  27.8 
 
 		 462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  29.65 
 
 		 464 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0583  gluconate transporter  26.13 
 
 		 453 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32757  normal  0.526328 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0557  gluconate transporter  26.13 
 
 		 453 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736742  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  25.28 
 
 		 452 aa  126  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03267  gluconate transporter, high-affinity GNT I system  28.44 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2333  Gluconate transporter  28.7 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.626027  normal  0.197447 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0298  gluconate transporter  28.44 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000270945  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03219  hypothetical protein  28.44 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000216048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3796  high-affinity gluconate transporter  28.44 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3891  high-affinity gluconate transporter  28.44 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3613  high-affinity gluconate transporter  28.44 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3696  high-affinity gluconate transporter  28.44 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.590418 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0298  gluconate transporter  28.44 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000171105  normal  0.0267385 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4722  high-affinity gluconate transporter  28.44 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3828  gluconate transporter  27.6 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6829  gluconate transporter  29.86 
 
 		 469 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>