61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2284 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2284  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 323 aa  634    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0993778  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2553  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  63.52 
 
 		 324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0117  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.48 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1390  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 		 468 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.057266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6671  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.314942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5207  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3862  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3102  hypothetical protein  33.02 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.142812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2432  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.66 
 
 		 312 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7185  putative signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8734  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0810  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0218  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  32.8 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.614577  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2189  hypothetical protein  31.86 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0960654  hitchhiker  0.00117014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12220  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  31.53 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4105  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.74 
 
 		 151 aa  85.9  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0408449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3724  ATPase domain-containing protein  44.33 
 
 		 163 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1514  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.63 
 
 		 127 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0502369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4824  hypothetical protein  26.82 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  35.59 
 
 		 148 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3592  transcriptional regulator, LuxR family  27.89 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118916  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 973 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  26.67 
 
 		 494 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1493  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.37 
 
 		 132 aa  52.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3107  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 151 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0842  hypothetical protein  23.08 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5525  hypothetical protein  24.46 
 
 		 218 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155419  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 810 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  47.92 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0731  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 		 139 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.993652  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 1359 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4828  hypothetical protein  23.46 
 
 		 205 aa  49.3  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.758784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 1370 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  34.62 
 
 		 1225 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0066  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.79 
 
 		 132 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 960 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  24 
 
 		 159 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  24 
 
 		 159 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0315  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 		 147 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  26.32 
 
 		 148 aa  46.2  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2515  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.68 
 
 		 148 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538602  normal  0.204677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2974  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 151 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2071  hypothetical protein  22.39 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  28.33 
 
 		 149 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0589  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 550 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0760576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 		 143 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  29.41 
 
 		 141 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  44.62 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  31.58 
 
 		 133 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  24 
 
 		 159 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03913  hypothetical protein  36.96 
 
 		 143 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.95 
 
 		 155 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000275353 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3554  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 127 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 		 153 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 		 151 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 		 142 aa  43.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 		 137 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.62 
 
 		 180 aa  42.7  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1572  putative signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 161 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8976  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 		 146 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 144 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>