26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7185 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7185  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 323 aa  646    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0810  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.76 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0218  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  45.98 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.614577  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6671  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.66 
 
 		 357 aa  211  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.314942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2189  hypothetical protein  39.33 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0960654  hitchhiker  0.00117014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8734  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.39 
 
 		 311 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12220  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  36.91 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3862  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3102  hypothetical protein  30.1 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.142812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2284  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.55 
 
 		 323 aa  95.9  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0993778  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5207  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.52 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2553  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4105  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.52 
 
 		 151 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0408449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3724  ATPase domain-containing protein  40 
 
 		 163 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2432  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1514  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.54 
 
 		 127 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0502369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1390  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 468 aa  56.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.057266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0066  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 		 132 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  25.57 
 
 		 494 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0117  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 1359 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5235  GAF sensor hybrid histidine kinase  24.86 
 
 		 757 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6820  histidine kinase  27.66 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 960 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  36.04 
 
 		 638 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  43.75 
 
 		 1045 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>