27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5525 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5525  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155419  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0842  hypothetical protein  55.05 
 
 		 220 aa  237  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4824  hypothetical protein  32.11 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4828  hypothetical protein  33.68 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.758784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3888  hypothetical protein  30.53 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 810 aa  112  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  27.44 
 
 		 494 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3592  transcriptional regulator, LuxR family  31.49 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118916  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 960 aa  99.4  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 614 aa  98.6  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 1359 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 614 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2071  hypothetical protein  32.79 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 		 626 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 973 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5016  hypothetical protein  31.32 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.705359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 1128 aa  82  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.37 
 
 		 736 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2076  hypothetical protein  26.92 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000127154  hitchhiker  0.000119468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3257  GGDEF domain-containing protein  24.59 
 
 		 531 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4864  DNA binding domain-containing protein  23.73 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.68065  normal  0.158916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8734  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2284  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 323 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0993778  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0218  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  29.41 
 
 		 331 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.614577  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  21.58 
 
 		 676 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2432  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.11 
 
 		 312 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0809  hypothetical protein  21.88 
 
 		 273 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>