32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3888 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3888  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  439  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4828  hypothetical protein  35.23 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.758784 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4824  hypothetical protein  33.86 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0842  hypothetical protein  32.31 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5525  hypothetical protein  30.53 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155419  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 973 aa  115  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 1359 aa  111  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 960 aa  109  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2071  hypothetical protein  30.51 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 1128 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3592  transcriptional regulator, LuxR family  28.79 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118916  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 626 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  25.28 
 
 		 494 aa  99.8  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2076  hypothetical protein  27.13 
 
 		 219 aa  91.7  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000127154  hitchhiker  0.000119468 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 		 736 aa  89.4  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 		 810 aa  88.6  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3257  GGDEF domain-containing protein  25.14 
 
 		 531 aa  88.2  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 614 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5016  hypothetical protein  20.35 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.705359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  25.38 
 
 		 676 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  24.39 
 
 		 1019 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  23.33 
 
 		 1248 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4864  DNA binding domain-containing protein  22.09 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.68065  normal  0.158916 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6183  histidine kinase  22.87 
 
 		 492 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8734  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  21.89 
 
 		 311 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  21.64 
 
 		 704 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0218  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  26.83 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.614577  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3102  hypothetical protein  20.45 
 
 		 345 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.142812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1908  histidine kinase  21.66 
 
 		 772 aa  42.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0199543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0117  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.36 
 
 		 331 aa  42.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0809  hypothetical protein  23.64 
 
 		 273 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>