35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2071 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2071  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4824  hypothetical protein  33.85 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4828  hypothetical protein  33.67 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.758784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3888  hypothetical protein  30.51 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3257  GGDEF domain-containing protein  31.67 
 
 		 531 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  33.15 
 
 		 494 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2076  hypothetical protein  31.58 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000127154  hitchhiker  0.000119468 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 810 aa  102  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3592  transcriptional regulator, LuxR family  31.86 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118916  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0842  hypothetical protein  33.16 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1359 aa  96.7  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5525  hypothetical protein  32.79 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155419  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 960 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 1128 aa  89.4  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 626 aa  81.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.41 
 
 		 736 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 973 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 614 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5016  hypothetical protein  26.04 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.705359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 614 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  23.84 
 
 		 676 aa  68.6  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  21.97 
 
 		 1019 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  19.53 
 
 		 1248 aa  58.9  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8734  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.84 
 
 		 311 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4864  DNA binding domain-containing protein  24.84 
 
 		 274 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.68065  normal  0.158916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  19.65 
 
 		 704 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0809  hypothetical protein  23.27 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6183  histidine kinase  21.74 
 
 		 492 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2431  anti-sigma-factor antagonist  24.52 
 
 		 281 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3863  anti-sigma-factor antagonist  23.95 
 
 		 286 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.873271  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1908  histidine kinase  24.72 
 
 		 772 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0199543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2189  hypothetical protein  24.34 
 
 		 323 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0960654  hitchhiker  0.00117014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2553  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 		 324 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0810  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.7 
 
 		 317 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3862  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 		 316 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>