29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2076 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2076  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000127154  hitchhiker  0.000119468 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  34.97 
 
 		 494 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 1128 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 960 aa  125  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 1359 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 810 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 626 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2071  hypothetical protein  31.58 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3257  GGDEF domain-containing protein  29 
 
 		 531 aa  95.9  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 614 aa  92.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3888  hypothetical protein  27.13 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 973 aa  88.6  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 614 aa  88.2  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4828  hypothetical protein  27.17 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.758784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0842  hypothetical protein  28.19 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4824  hypothetical protein  25.26 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3592  transcriptional regulator, LuxR family  29.51 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118916  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.17 
 
 		 736 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5525  hypothetical protein  26.92 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155419  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  23.21 
 
 		 1248 aa  69.3  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  23.71 
 
 		 676 aa  67.4  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5016  hypothetical protein  28.16 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.705359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 1019 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3862  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 316 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 704 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6183  histidine kinase  28.21 
 
 		 492 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1908  histidine kinase  25.86 
 
 		 772 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0199543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2432  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.49 
 
 		 312 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4864  DNA binding domain-containing protein  21.47 
 
 		 274 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.68065  normal  0.158916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>