27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0842 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0842  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5525  hypothetical protein  54.46 
 
 		 218 aa  245  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155419  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4824  hypothetical protein  33.5 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3888  hypothetical protein  32.31 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4828  hypothetical protein  33.68 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.758784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 1359 aa  118  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 810 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 960 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  30.77 
 
 		 494 aa  105  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 614 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 614 aa  99.8  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2071  hypothetical protein  33.16 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 1128 aa  98.6  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3592  transcriptional regulator, LuxR family  30.39 
 
 		 293 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118916  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 626 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 		 973 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2076  hypothetical protein  28.65 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000127154  hitchhiker  0.000119468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3257  GGDEF domain-containing protein  24.29 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.73 
 
 		 736 aa  68.6  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5016  hypothetical protein  21.98 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.705359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  21.21 
 
 		 676 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  21.21 
 
 		 1019 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  21.64 
 
 		 1248 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4864  DNA binding domain-containing protein  22.03 
 
 		 274 aa  52.4  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.68065  normal  0.158916 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2432  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.72 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3862  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.89 
 
 		 316 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2284  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 323 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0993778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>