20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2431 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2431  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 281 aa  544  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288331  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23220  hypothetical protein  30.68 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3592  transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118916  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  26.06 
 
 		 494 aa  58.9  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 1128 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 960 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 614 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  25 
 
 		 676 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 810 aa  52.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 1359 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2071  hypothetical protein  24.52 
 
 		 208 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  26.09 
 
 		 1248 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 614 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4824  hypothetical protein  26.09 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0809  hypothetical protein  29.71 
 
 		 273 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  35.63 
 
 		 117 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2432  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 		 626 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3257  GGDEF domain-containing protein  21.76 
 
 		 531 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3863  anti-sigma-factor antagonist  24.54 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.873271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>