63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1948 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1948  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 78 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.861466  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  52.05 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  55.13 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1429  prevent-host-death family protein  50.65 
 
 		 81 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  47.3 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3677  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763489  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0266  prevent-host-death family protein  46.84 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000350638  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  40.24 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  46.84 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3504  hypothetical protein  50.77 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000315772  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3368  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1573  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2969  prevent-host-death family protein  47.89 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2334  prevent-host-death protein  47.89 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2948  prevent-host-death family protein  47.89 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0199  prevent-host-death family protein  45 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.172056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  36.25 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6300  hypothetical protein  45.07 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1455  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2530  prevent-host-death family protein  38.67 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00630  Prevent-host-death protein  44.29 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000263999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4044  prevent-host-death protein  36.84 
 
 		 78 aa  50.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.104043  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  66.67 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  43.28 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1037  prevent-host-death family protein  37.18 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5378  prevent-host-death family protein  37.93 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.963401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0766  prevent-host-death protein  40.62 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27663  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0994  prevent-host-death protein  34.18 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3329  prevent-host-death family protein  46.67 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4693  prevent-host-death family protein  37.31 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.490167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1433  prevent-host-death protein  40.54 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205341  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4538  prevent-host-death family protein  35.9 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  59.52 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  59.52 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3011  prevent-host-death family protein  56.82 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2954  hypothetical protein  41.33 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  54.55 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  35.94 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  57.14 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  61.54 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  48.78 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  45.59 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1704  prevent-host-death family protein  52.5 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1698  prevent-host-death family protein  52.5 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.032948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  58.14 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3716  prevent-host-death family protein  39.71 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1406  prevent-host-death family protein  58.33 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  54.76 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2939  prevent-host-death family protein  37.97 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.275009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  35.44 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4124  prevent-host-death family protein  43.08 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167501  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  35.44 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6159  prevent-host-death family protein  52.17 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2443  prevent-host-death family protein  53.19 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0810105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  35.44 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2735  prevent-host-death family protein  34.62 
 
 		 86 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2599  prevent-host-death family protein  44.07 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143583  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2996  prevent-host-death family protein  34.62 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206214  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  42.65 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2223  prevent-host-death family protein  61.11 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1816  prevent-host-death family protein  54.05 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00000021208  hitchhiker  0.0000000000223341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3314  hypothetical protein  36.84 
 
 		 91 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35775  normal  0.654325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>