More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1409 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1409  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
176 aa  342  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3217  phosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
181 aa  134  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124078  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  38 
 
 
177 aa  94.4  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
181 aa  89  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  39.31 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
172 aa  84  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  36.81 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 
177 aa  82  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  39.23 
 
 
424 aa  82  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  37.4 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  39.87 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  35 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 
177 aa  79  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  35 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  37.4 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  35.66 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  35.21 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2871  phosphoribosyltransferase  41.35 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
185 aa  77.4  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  37.69 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  34 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  35.38 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  33.08 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  36.15 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  35.38 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  35 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  34 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  34 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  38.62 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0802  adenine phosphoribosyltransferase  41.54 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0798  adenine phosphoribosyltransferase  41.54 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0128483  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  34.35 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0680  adenine phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 
198 aa  74.3  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  38.06 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29461  adenine phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.268301  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  32.82 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  32.82 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13880  adenine phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.635045  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2383  adenine phosphoribosyltransferase  39.69 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106176  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>