More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0415 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0415  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
382 aa  736    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
370 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
373 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
363 aa  102  9e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
370 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  36.22 
 
 
379 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
387 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
387 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.48 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 
394 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  29.74 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 
401 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 
414 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 
414 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 
414 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.74 
 
 
414 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 
535 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
433 aa  87.4  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
395 aa  87  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  30.52 
 
 
380 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
400 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
382 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
417 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0856  glycosyl transferase group 1  21.36 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0476116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
364 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  26.74 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  22.26 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3559  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23554  normal  0.448657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  36.86 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  29.07 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 
434 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  28.8 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
437 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.37 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2942  glycosyl transferase group 1  33.47 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  27.88 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6405  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.776325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  28.8 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  30.24 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  26.49 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  23.71 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  22.97 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  29.44 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2683  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
420 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1330  glycosyltransferase WbpX, putative  31.74 
 
 
520 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13921  putative glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.69221  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  39.39 
 
 
418 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
380 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
366 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2280  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
367 aa  77  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00320483  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
524 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
377 aa  77  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0447  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.429575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  37.85 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
1261 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
1241 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
831 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  37.59 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0744  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
1666 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>