More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2654 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2654  thioredoxin-related protein  100 
 
 		 370 aa  746    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.540425 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2652  thioredoxin-related protein  55.71 
 
 		 346 aa  329  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.146231  normal  0.224763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  39.81 
 
 		 107 aa  93.2  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  36.89 
 
 		 108 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1139  Thioredoxin domain protein  43.82 
 
 		 106 aa  91.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  37.74 
 
 		 110 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  37.86 
 
 		 107 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  42.57 
 
 		 106 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  42.57 
 
 		 106 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0117  Thioredoxin domain protein  46.07 
 
 		 105 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  42.57 
 
 		 106 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  41.18 
 
 		 105 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  37.25 
 
 		 105 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  33.66 
 
 		 108 aa  87.4  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  36.73 
 
 		 107 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  34.95 
 
 		 107 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  40.62 
 
 		 109 aa  86.7  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  32.67 
 
 		 108 aa  86.3  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  38.24 
 
 		 107 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  37.38 
 
 		 148 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  32.14 
 
 		 140 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  32.14 
 
 		 140 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  38.3 
 
 		 107 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  32.73 
 
 		 140 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  38.3 
 
 		 107 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  37.23 
 
 		 109 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  37.25 
 
 		 106 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  41.84 
 
 		 108 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  36.89 
 
 		 109 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  33.33 
 
 		 140 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  38 
 
 		 108 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  37.23 
 
 		 109 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  32.08 
 
 		 107 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  35.51 
 
 		 109 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  32.08 
 
 		 107 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  33.03 
 
 		 146 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  35.64 
 
 		 124 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  39.33 
 
 		 107 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  35.71 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  30.84 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  33 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  33.98 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  33 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  33 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  33 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  33 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  32.32 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  36 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  32.99 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  33 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  31.25 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  31.68 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  31.68 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  35.71 
 
 		 107 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  31.68 
 
 		 108 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  36.36 
 
 		 107 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  31 
 
 		 108 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  32.67 
 
 		 108 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  35 
 
 		 120 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  30.69 
 
 		 108 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  34.29 
 
 		 109 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  31.68 
 
 		 108 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  31.68 
 
 		 108 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  37.14 
 
 		 119 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  31.68 
 
 		 108 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  33.67 
 
 		 110 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  33.33 
 
 		 111 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  42.7 
 
 		 105 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  30.93 
 
 		 108 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  37.14 
 
 		 106 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  32.99 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  37.63 
 
 		 110 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  32.26 
 
 		 123 aa  81.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  31.82 
 
 		 170 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  33.02 
 
 		 109 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  36.73 
 
 		 106 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  34.34 
 
 		 108 aa  82  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  41.3 
 
 		 106 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  35 
 
 		 110 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  34 
 
 		 108 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  34.65 
 
 		 109 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  31.68 
 
 		 108 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  31.13 
 
 		 107 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  33.02 
 
 		 109 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  29.25 
 
 		 109 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  34.69 
 
 		 106 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  37.23 
 
 		 109 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  40.86 
 
 		 107 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  32.35 
 
 		 108 aa  80.9  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  31.68 
 
 		 108 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  35.24 
 
 		 107 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  35.24 
 
 		 107 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  33.01 
 
 		 112 aa  80.9  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>