More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2652 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2652  thioredoxin-related protein  100 
 
 		 346 aa  697    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.146231  normal  0.224763 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2654  thioredoxin-related protein  55.71 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.540425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  38.18 
 
 		 110 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  38.68 
 
 		 109 aa  93.6  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  42.16 
 
 		 108 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  32.8 
 
 		 140 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  32.8 
 
 		 140 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  40.2 
 
 		 108 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  37.76 
 
 		 107 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  42 
 
 		 105 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  39.6 
 
 		 108 aa  90.9  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.81 
 
 		 148 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  32 
 
 		 140 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  39.22 
 
 		 108 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  39.22 
 
 		 108 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  38.83 
 
 		 108 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  31.45 
 
 		 140 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  39.22 
 
 		 108 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  39.22 
 
 		 108 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  38.83 
 
 		 108 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  38.83 
 
 		 108 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  38.83 
 
 		 108 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  36.89 
 
 		 108 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  36.89 
 
 		 107 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  36.73 
 
 		 107 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  38 
 
 		 108 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  37.86 
 
 		 108 aa  87.4  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  34.26 
 
 		 120 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  38.46 
 
 		 109 aa  87.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  36.63 
 
 		 107 aa  87.4  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  87  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  38.24 
 
 		 108 aa  87.4  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  37.86 
 
 		 108 aa  87  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  37.62 
 
 		 107 aa  86.7  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  32.43 
 
 		 144 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  38.71 
 
 		 108 aa  86.3  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  34.34 
 
 		 107 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  35.24 
 
 		 108 aa  86.3  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  31.2 
 
 		 140 aa  86.3  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  37.14 
 
 		 107 aa  85.9  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  32.73 
 
 		 144 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  31.2 
 
 		 170 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  33.65 
 
 		 107 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  33.65 
 
 		 107 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  39 
 
 		 150 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  34.29 
 
 		 110 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  34.26 
 
 		 109 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  35.29 
 
 		 108 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  84.7  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  38.14 
 
 		 109 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  36.63 
 
 		 108 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  31.2 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  31.2 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  34.95 
 
 		 108 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  36.45 
 
 		 109 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  34.31 
 
 		 108 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  30.71 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  34.26 
 
 		 109 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  37.11 
 
 		 107 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  34.65 
 
 		 108 aa  84  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  37.14 
 
 		 107 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  37.62 
 
 		 108 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  32.14 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  32.14 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  32.14 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  32.14 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  32.14 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  30.83 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  30.91 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  35.24 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  34 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  45.45 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  34 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  36.08 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  36.08 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  36.08 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  34.62 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  36.63 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  30.36 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  30.36 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  36.73 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  37.14 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  37.14 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  36.73 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  36.17 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  36.17 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  38.24 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  30.36 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  34.26 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  30.36 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  30.36 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  30.36 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  37.23 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  38.24 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  32.69 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  34.62 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  30.36 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  30.36 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>