More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1719 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1719  thiolase  100 
 
 		 391 aa  784    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000100709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3302  thiolase  96.68 
 
 		 391 aa  764    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3043  acetyl-CoA acetyltransferase  73.66 
 
 		 391 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2835  acetyl-CoA acetyltransferase  72.12 
 
 		 391 aa  570  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1378  acetyl-CoA acetyltransferase  70.84 
 
 		 391 aa  565  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2074  thiolase  70.59 
 
 		 391 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000106789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  67.26 
 
 		 391 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.172514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2794  acetyl-CoA acetyltransferase  67.01 
 
 		 391 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3574  acetyl-CoA acetyltransferase  63.85 
 
 		 392 aa  500  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1677  acetyl-CoA acetyltransferase  52.58 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2771  acetyl-CoA acetyltransferases  52.32 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2597  acetyl-CoA acetyltransferases  52.06 
 
 		 396 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124801  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2664  acetyl-CoA acetyltransferases  52.32 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1525  acetyl-CoA acetyltransferase  52.58 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1489  acetyl-CoA acetyltransferase  52.06 
 
 		 396 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1495  acetyl-CoA acetyltransferase  52.32 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1338  acetyl-CoA acetyltransferases  51.55 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.671481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2856  acetyl-CoA acetyltransferase  52.32 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.700785  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1397  acetyl-CoA acetyltransferase  51.8 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2011  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271302  normal  0.806443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2117  acetyl-CoA acetyltransferase  51.03 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.465032  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1943  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.55 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3202  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.573759  hitchhiker  0.000000552223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  51.03 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.184491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1473  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.65 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066272 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0252  putative acetyl-CoA acyltransferase  48.45 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.152844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1667  acetyl-CoA acetyltransferase  51.29 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00240927  normal  0.0395085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3662  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02410  acetyl-CoA acetyltransferase with thiolase domain  50.26 
 
 		 416 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0732  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1182  putative acyl-CoA thiolase  49.61 
 
 		 391 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3776  acetyl-CoA acetyltransferases  49.36 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3575  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313168  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2696  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0145764  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5988  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0278  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.7 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000883017  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6443  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3054  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1375  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.64 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.692424  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2547  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1789  hypothetical protein  48.59 
 
 		 394 aa  368  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000375  3-ketoacyl-CoA thiolase (isoleucine degradation)  48.32 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.587204  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2306  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.36 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3149  phosphoryl transfer system, HPr  48.47 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01744  acetoacetyl-CoA thiolase  52.17 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.569718  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2923  acetyl-CoA acetyltransferases  49.49 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1788  hypothetical protein  48.08 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2430  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3306  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13090  putative acyl-CoA thiolase  49.36 
 
 		 391 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2036  acetyl-CoA acetyltransferase  48.32 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.657268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 392 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2907  acetyl-CoA acetyltransferases  51.16 
 
 		 393 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3105  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.61 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0273238 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4561  thiolase  48.2 
 
 		 393 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3107  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 		 396 aa  362  6e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  47.42 
 
 		 399 aa  362  6e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158877 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 394 aa  362  8e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0276  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00380599  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0458  acetyl-CoA acetyltransferases  48.84 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1910  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.126312 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0178  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 396 aa  359  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4665  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 		 398 aa  359  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226383  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 392 aa  359  4e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0781  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  46.79 
 
 		 395 aa  359  5e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  359  6e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1594  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 393 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4255  acetyl-CoA acetyltransferase  47.3 
 
 		 402 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1001  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 		 400 aa  358  7e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 392 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4732  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 		 394 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0344  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0096  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.825605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0579  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3781  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.338969  normal  0.300645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1891  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.84 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0417  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0461  acetyl-CoA acetyltransferase  47.04 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.843393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2365  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1499  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2010  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2277  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4187  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.85 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2901  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255971  normal  0.0133892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 393 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0134  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 393 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3602  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 		 394 aa  355  7.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1331  acetyl-CoA acetyltransferases  52.04 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349273 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 		 392 aa  355  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.49 
 
 		 396 aa  355  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 392 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 393 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>