42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1340 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  100 
 
 		 136 aa  275  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  56.91 
 
 		 136 aa  140  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  43.9 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3013  PilT domain-containing protein  49.21 
 
 		 133 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  45.6 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  46.46 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  36.75 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  41.88 
 
 		 140 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  41.88 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  41.88 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  42.5 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  35.9 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3501  PilT protein-like  37.5 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3010  PilT protein-like  39.13 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  33.6 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  36.72 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  30.51 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03477  PilT-like protein  31.34 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  35.04 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0621  PilT protein domain protein  36.92 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3693  PilT protein-like  35 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0275  hypothetical protein  34.51 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  30.16 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  31.93 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  33.88 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  37.66 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1205  PilT protein domain protein  35.38 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00010263  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3176  hypothetical protein  38.61 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  33.09 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 132 aa  48.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  30.95 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  31.07 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  31.86 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00890  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain protein  30.58 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  42.19 
 
 		 133 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  25.81 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  32.14 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  32.14 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  39.34 
 
 		 133 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1430  hypothetical protein  36.36 
 
 		 100 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.443392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2399  PilT protein domain protein  31.58 
 
 		 147 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108207  decreased coverage  0.00132588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>