More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1189 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  100 
 
 
365 aa  741    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  60.96 
 
 
355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  66.95 
 
 
354 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  55.56 
 
 
367 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  53.85 
 
 
353 aa  431  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  54.42 
 
 
353 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  57.93 
 
 
351 aa  418  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  56.18 
 
 
357 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  57.06 
 
 
351 aa  412  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  52.71 
 
 
353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  53.14 
 
 
354 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  53.09 
 
 
357 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  50.14 
 
 
354 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  51 
 
 
354 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.42 
 
 
353 aa  365  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  51.27 
 
 
356 aa  363  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.67 
 
 
354 aa  362  8e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  54.15 
 
 
341 aa  360  2e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.88 
 
 
354 aa  358  6e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.57 
 
 
354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.86 
 
 
354 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  47.71 
 
 
354 aa  350  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.99 
 
 
372 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.92 
 
 
547 aa  350  2e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  50.84 
 
 
363 aa  348  7e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.48 
 
 
374 aa  345  6e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.46 
 
 
355 aa  344  2e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.6 
 
 
355 aa  340  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  43.55 
 
 
363 aa  334  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.49 
 
 
375 aa  333  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  44.93 
 
 
375 aa  332  4e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  46.18 
 
 
358 aa  332  7.000000000000001e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.87 
 
 
387 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.48 
 
 
385 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.48 
 
 
385 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  41.83 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.71 
 
 
383 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.27 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.74 
 
 
379 aa  299  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.87 
 
 
376 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.55 
 
 
362 aa  297  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.48 
 
 
382 aa  297  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  43.33 
 
 
354 aa  295  8e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.81 
 
 
360 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  40.62 
 
 
354 aa  285  8e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  40.06 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  40.55 
 
 
367 aa  282  6.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.04 
 
 
348 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  40 
 
 
381 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  40 
 
 
381 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.37 
 
 
381 aa  278  8e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.38 
 
 
352 aa  276  6e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.27 
 
 
360 aa  275  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.56 
 
 
357 aa  275  7e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.66 
 
 
352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.5 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.09 
 
 
352 aa  273  3e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.78 
 
 
353 aa  271  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.72 
 
 
395 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.78 
 
 
368 aa  270  4e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.45 
 
 
374 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.35 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.57 
 
 
327 aa  249  4e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.33 
 
 
387 aa  248  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.47 
 
 
356 aa  247  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.65 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.12 
 
 
332 aa  239  8e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.94 
 
 
355 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.12 
 
 
327 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.64 
 
 
351 aa  222  8e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
339 aa  215  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.63 
 
 
339 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.1 
 
 
316 aa  210  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.6 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.36 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.76 
 
 
333 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.12 
 
 
325 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.17 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.14 
 
 
291 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00453  magnesium and cobalt transport protein  37.19 
 
 
333 aa  176  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.9 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1207  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.52 
 
 
358 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2270  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.78 
 
 
314 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0371321  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.11 
 
 
325 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2140  magnesium/cobalt transporter CorA  34.8 
 
 
323 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2129  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.01 
 
 
315 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0400102  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2181  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.78 
 
 
314 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0833206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2307  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.9 
 
 
322 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  31.17 
 
 
366 aa  166  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1675  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.77 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  32.38 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.42 
 
 
357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  31 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2565  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.63 
 
 
331 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.98 
 
 
324 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1347  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.92 
 
 
340 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.25 
 
 
316 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.33 
 
 
367 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0065  Mg2+ transporter protein, CorA-like  31.72 
 
 
323 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.65 
 
 
370 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>