52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2367 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 
254 aa  520  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  45.45 
 
 
247 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  45.11 
 
 
255 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  33.74 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  35.32 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  36.33 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  31.71 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  31.3 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  31.3 
 
 
246 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  27.13 
 
 
253 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  32.4 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  30.17 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  30.47 
 
 
247 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  33.33 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  30.47 
 
 
256 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  27.23 
 
 
252 aa  109  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  28.57 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  29.86 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  28.57 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  27.46 
 
 
247 aa  96.3  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  30.89 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  31.31 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  26.96 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  29.27 
 
 
237 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  28.36 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  27.48 
 
 
238 aa  82  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  22.79 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  25.78 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  24.07 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2218  hypothetical protein  24.61 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  26.5 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  23.32 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  30.17 
 
 
295 aa  68.6  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  22.93 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1403  Acyl-ACP thioesterase  25.91 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  23.67 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  27.04 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  26.53 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  26.98 
 
 
163 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  23.71 
 
 
231 aa  52.4  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
154 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12033  hypothetical protein  26.95 
 
 
250 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  20.13 
 
 
155 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  20.13 
 
 
155 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0628  acyl-ACP thioesterase  19.88 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0635  acyl-ACP thioesterase  19.88 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0648  acyl-ACP thioesterase  19.88 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
145 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
136 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0800  acyl-ACP thioesterase  20.48 
 
 
271 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270685  normal  0.871295 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  25.23 
 
 
139 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  23.58 
 
 
138 aa  42  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>