More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0627 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0627  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
322 aa  668    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000395521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2723  putative sulfite oxidase subunit YedY  64.38 
 
 
325 aa  448  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0560  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.54 
 
 
317 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0505928  normal  0.0124744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5829  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.35 
 
 
324 aa  295  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2658  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.75 
 
 
311 aa  293  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.708237  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3696  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.25 
 
 
326 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3750  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.25 
 
 
326 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.677128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.39 
 
 
319 aa  289  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2049  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.27 
 
 
315 aa  289  6e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00190211  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0197  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.31 
 
 
322 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359289  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2142  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.37 
 
 
330 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0157  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.17 
 
 
321 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.337145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2134  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.2 
 
 
302 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2717  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.38 
 
 
327 aa  278  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0060  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.27 
 
 
330 aa  275  9e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1981  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.2 
 
 
340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141842  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.78 
 
 
340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2527  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.58 
 
 
345 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.48 
 
 
331 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.21 
 
 
328 aa  268  7e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.57 
 
 
335 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.17 
 
 
331 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.17 
 
 
331 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.17 
 
 
331 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.17 
 
 
331 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.17 
 
 
331 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2103  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.51 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.890821  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.75 
 
 
320 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2734  putative sulfite oxidase subunit YedY  51 
 
 
321 aa  266  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.67 
 
 
333 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.4 
 
 
311 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.63 
 
 
331 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1865  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.9 
 
 
344 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.728701  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0877  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.36 
 
 
322 aa  265  8e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.687916  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1893  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.81 
 
 
334 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.772909  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2042  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.29 
 
 
344 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2109  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.6 
 
 
344 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.327015  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  42.36 
 
 
331 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.26 
 
 
331 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.63 
 
 
332 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.19 
 
 
310 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  42.6 
 
 
331 aa  262  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.6 
 
 
344 aa  262  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0371  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.34 
 
 
320 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.789292 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2055  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.34 
 
 
344 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00062173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.58 
 
 
333 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.83 
 
 
366 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1758  putative sulfite oxidase subunit YedY  42.44 
 
 
325 aa  259  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2283  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.34 
 
 
344 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0379362  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4557  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.34 
 
 
344 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  42.32 
 
 
332 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2271  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.34 
 
 
344 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0141273  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01069  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.44 
 
 
335 aa  259  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2102  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.34 
 
 
344 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.83 
 
 
366 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  42.77 
 
 
319 aa  259  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  42.77 
 
 
319 aa  259  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  45 
 
 
338 aa  258  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2345  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.37 
 
 
347 aa  258  7e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.95 
 
 
315 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.31 
 
 
331 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.51 
 
 
366 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  45.05 
 
 
317 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.55 
 
 
334 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.12 
 
 
332 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.04 
 
 
336 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1017  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.48 
 
 
317 aa  256  3e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  47.79 
 
 
331 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5586  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.73 
 
 
326 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18066  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  41.77 
 
 
322 aa  256  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.12 
 
 
332 aa  255  8e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  42.64 
 
 
333 aa  255  9e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  41.72 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  41.74 
 
 
341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.56 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.48 
 
 
331 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  46.56 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.1 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  44.1 
 
 
334 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.62 
 
 
313 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  43.79 
 
 
334 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.79 
 
 
334 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.79 
 
 
334 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  43.79 
 
 
334 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.79 
 
 
334 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.93 
 
 
313 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  40.62 
 
 
315 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.79 
 
 
334 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.56 
 
 
334 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.79 
 
 
334 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  42.99 
 
 
318 aa  249  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  41.9 
 
 
332 aa  249  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.21 
 
 
313 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  42.33 
 
 
333 aa  248  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  48.05 
 
 
315 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3569  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.48 
 
 
334 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0584327  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3568  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.48 
 
 
334 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00040411  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  42.04 
 
 
331 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1578  putative sulfite oxidase subunit YedY  43.69 
 
 
297 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  42.27 
 
 
331 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>