More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3237 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3237  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 70 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.28951  normal  0.700425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  56.45 
 
 		 1071 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  44.78 
 
 		 833 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 942 aa  58.9  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  44.78 
 
 		 826 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  45.59 
 
 		 75 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_203  P-ATPase family transporter: copper ion; heavy metal translocating P-type ATPase-like protein  44.62 
 
 		 761 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.512423 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 838 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 885 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 938 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 836 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  35.29 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  44.78 
 
 		 849 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 836 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 		 802 aa  53.9  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 802 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 802 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 836 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 837 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 805 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 861 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 805 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 805 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 		 795 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  36.51 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2925  heavy metal translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 767 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  38.46 
 
 		 954 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 837 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.33 
 
 		 794 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 748 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  40.68 
 
 		 831 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  38.46 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 821 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 824 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  36.76 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  46.88 
 
 		 837 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  37.14 
 
 		 1182 aa  51.2  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  48.39 
 
 		 872 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 814 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  43.28 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  31.43 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 		 811 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  41.27 
 
 		 811 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  32.86 
 
 		 73 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1925  copper-translocating P-type ATPase  47.46 
 
 		 838 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.715176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  47.06 
 
 		 971 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  30.88 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  30.88 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  30.88 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  30.88 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  30.88 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  32.31 
 
 		 1196 aa  50.1  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 839 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 820 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  36.92 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 826 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 976 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 821 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4423  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 		 817 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332759  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 837 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 798 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  44.12 
 
 		 1061 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  44.78 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  44.12 
 
 		 1061 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 699 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  34.85 
 
 		 209 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  30.88 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  44.12 
 
 		 1063 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  39.39 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 816 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  47.76 
 
 		 804 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  30.88 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  30.88 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  38.24 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  29.41 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3962  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 737 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0396951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  35.38 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  44.12 
 
 		 1061 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  44.12 
 
 		 1061 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3948  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 737 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  43.48 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  44.12 
 
 		 1063 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4022  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 737 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 818 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 759 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  27.94 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 825 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  33.33 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 759 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  46.27 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5305  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 		 782 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.585321  normal  0.36068 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5704  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 		 782 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.563796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 		 782 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0968777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 737 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>