More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4791 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 383 aa  757    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3143  aminotransferase  51.34 
 
 		 381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2784  aminotransferase class I and II  46.02 
 
 		 421 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2586  aminotransferase, class I and II  46.77 
 
 		 415 aa  286  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14610  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  44 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.427424  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2967  aminotransferase class I and II  49.21 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0077692  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0099  aminotransferase class I and II  42.78 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12317  aminotransferase  41.81 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  36.94 
 
 		 514 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  40.59 
 
 		 386 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  39.79 
 
 		 391 aa  236  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  40.63 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  34.57 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  35.47 
 
 		 390 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  32.54 
 
 		 390 aa  229  5e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  36.29 
 
 		 390 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  38.38 
 
 		 385 aa  229  9e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10075  aminotransferase  39.78 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.8846  normal  0.0279685 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1601  bifunctional PLP-dependent enzyme  35.86 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  36.24 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2509  aminotransferase class I and II  38.86 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  32.32 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  37.15 
 
 		 405 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 		 391 aa  219  8.999999999999998e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  35.42 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  35.12 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  37.98 
 
 		 383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  33.6 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  38.55 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  33.79 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  27.17 
 
 		 383 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  33.95 
 
 		 393 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  35.71 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  30.29 
 
 		 386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  35.01 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4578  aminotransferase, class I and II  40.99 
 
 		 386 aa  199  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.764552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  34.2 
 
 		 386 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  26.63 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  26.9 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  26.63 
 
 		 383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  36.19 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  26.65 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  30.11 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  34.05 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  26.63 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  31.25 
 
 		 400 aa  196  7e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  37.74 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  33.86 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  30.87 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  26.36 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  26.36 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  29.51 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  26.37 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  29.51 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  29.38 
 
 		 521 aa  192  8e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  26.1 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  25.82 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  30.81 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 		 384 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  36.13 
 
 		 393 aa  190  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  30.77 
 
 		 395 aa  189  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  30.75 
 
 		 394 aa  189  5e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0696  aminotransferase class I and II  36.27 
 
 		 385 aa  190  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  29.05 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  30.63 
 
 		 393 aa  189  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  34.04 
 
 		 387 aa  189  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  34.25 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  34.37 
 
 		 414 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  32.23 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2428  aminotransferase class I and II  37.47 
 
 		 370 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  27.61 
 
 		 386 aa  186  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  34.34 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  27.68 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  30.92 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  27.32 
 
 		 397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  34.46 
 
 		 386 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  32.98 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  32.98 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  33.24 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  29.69 
 
 		 390 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  30.11 
 
 		 379 aa  176  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  32.27 
 
 		 383 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  31.84 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  33.61 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  31.84 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  32.58 
 
 		 392 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  27.27 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  34.5 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  28.25 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  30.23 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  31.75 
 
 		 387 aa  169  8e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  33.96 
 
 		 393 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  28.61 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1562  protein MalY  33.15 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00682434  normal  0.389614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6328  aminotransferase class I and II  33.71 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.657142  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  27.51 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  29.82 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  26.39 
 
 		 397 aa  166  5e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>