More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4687 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4687  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 367 aa  734    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1218  glycosyl transferase, group 1  73.18 
 
 		 364 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14341 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2055  glycosyl transferase group 1  63.46 
 
 		 370 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.214984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6665  glycosyl transferase group 1  56.51 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143503  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  37.23 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2623  glycosyl transferase group 1  38.44 
 
 		 391 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  36.84 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1996  glycosyl transferase group 1  37.3 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  35.57 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  36 
 
 		 422 aa  186  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4565  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5397  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0061  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 		 391 aa  169  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.125882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3078  glycosyl transferase group 1  36.29 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0249  glycosyl transferase group 1  35.65 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.673407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  36.06 
 
 		 371 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 381 aa  96.3  7e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 		 408 aa  92.8  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  38.64 
 
 		 366 aa  92.8  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  35.32 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 369 aa  90.5  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  36.4 
 
 		 382 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 382 aa  89.7  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0060  glycosyltransferase  38.51 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.377233  normal  0.16157 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  35.02 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  38.67 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  35.38 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  35.44 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  40.78 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  32.14 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  35.75 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  36.41 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.14 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.51 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0881  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0507523  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  28.96 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.89 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  35.91 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2072  group 1 glycosyl transferase  30.24 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.47 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 		 376 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.3 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.27 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1677  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.26 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>