More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3155 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  100 
 
 		 164 aa  328  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  97.56 
 
 		 164 aa  321  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  73.86 
 
 		 169 aa  245  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  70.73 
 
 		 178 aa  245  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  69.93 
 
 		 163 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  69.93 
 
 		 157 aa  237  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  69.51 
 
 		 164 aa  237  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  72.6 
 
 		 162 aa  228  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  64.05 
 
 		 167 aa  213  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  65.54 
 
 		 164 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  60.98 
 
 		 164 aa  202  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  59.76 
 
 		 164 aa  202  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  58.55 
 
 		 161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  58.97 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  57.14 
 
 		 163 aa  190  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  60.27 
 
 		 179 aa  188  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  53.21 
 
 		 171 aa  187  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  54.14 
 
 		 185 aa  186  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  52.15 
 
 		 185 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  55.1 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  51.01 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  53.95 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  53.59 
 
 		 173 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  53.38 
 
 		 169 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  47.44 
 
 		 185 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  49.67 
 
 		 194 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  49.02 
 
 		 192 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  48.37 
 
 		 194 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  46.84 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  44.23 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  45.64 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  45.81 
 
 		 184 aa  141  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  41.45 
 
 		 187 aa  138  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  42.86 
 
 		 179 aa  137  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  45.21 
 
 		 212 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  43.4 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  43.05 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  44.37 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  48.55 
 
 		 194 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  48.18 
 
 		 191 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  48.18 
 
 		 191 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  42.38 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  44.81 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  40.25 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  43.23 
 
 		 194 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  43.23 
 
 		 194 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  47.1 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  38.46 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.4 
 
 		 178 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  37.33 
 
 		 179 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  40.49 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  40.62 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  40.13 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  40.52 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  43.36 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  39.74 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.14 
 
 		 174 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  37.5 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  39.19 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  40.14 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  40.14 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  40 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  41.38 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  41.4 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  40.56 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  40.4 
 
 		 171 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  37.75 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  39.74 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  39.74 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  40.13 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  38.78 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  39.31 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  37.58 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  39.19 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  40.27 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  39.74 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  39.74 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  39.49 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  39.74 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  39.74 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  39.74 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  40.27 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  40.69 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  39.16 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  40 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  41.38 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  41.38 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  40.69 
 
 		 174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  41.38 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  41.38 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  38.1 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  41.38 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  41.38 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  41.38 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>