More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0814 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 308 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  95.78 
 
 		 308 aa  589  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  62.58 
 
 		 305 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  65.73 
 
 		 309 aa  364  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  64.38 
 
 		 308 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  58.5 
 
 		 304 aa  329  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.12 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  32.26 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  32.26 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  27.94 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  32.73 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  31.91 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.6 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  33.09 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  31.62 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.64 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  33.84 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.6 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  28.34 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  29.9 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  29.93 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  31.23 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.45 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 		 301 aa  112  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  32.35 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  28.67 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  29.55 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  29.55 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  29.55 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  29.55 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  29.55 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  30.18 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  29.55 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  28.38 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  27.97 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  30.42 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  27.97 
 
 		 303 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  27.62 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.88 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  29.69 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  28.57 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.8 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  32.73 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  29.17 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.46 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  27.94 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  28.82 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  30.18 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  30.56 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  27.69 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  30.56 
 
 		 358 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  30.31 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  28.62 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 		 315 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  29.63 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  29.76 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  30.2 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  26.24 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  30.2 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  25.8 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  31.17 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 287 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  26.64 
 
 		 336 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 283 aa  95.9  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  30.03 
 
 		 314 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  25.35 
 
 		 288 aa  95.5  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  28.07 
 
 		 307 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  28.62 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  28.07 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1261  hypothetical protein  27.61 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.647772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  30.87 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  26.86 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  26.92 
 
 		 309 aa  93.2  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  25.18 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  29.1 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  26.02 
 
 		 310 aa  92.8  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.96 
 
 		 252 aa  92.8  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  30.9 
 
 		 316 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  28.87 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  30.53 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0201  hypothetical protein  29.3 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.930951  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  27.72 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  32 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  30.4 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  26.94 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  29.11 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>