30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0377 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  485  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  96.15 
 
 		 234 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  63.64 
 
 		 236 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  58.55 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  49.14 
 
 		 231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  48.71 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  45.69 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  44.4 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  42.74 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  44.02 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  43.1 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  43.53 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  43.59 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  26.5 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  28.12 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  24.88 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  24.08 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  24.73 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  24.04 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  25.54 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  23.9 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  22.33 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  24.62 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  23.79 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  24.44 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  27.75 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  22.53 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  22.28 
 
 		 275 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  26.37 
 
 		 209 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  25.41 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>