More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0056 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 385 aa  784    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  95.32 
 
 		 392 aa  756    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  66.4 
 
 		 385 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  67.73 
 
 		 383 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  59.42 
 
 		 381 aa  471  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  58.27 
 
 		 386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  56.74 
 
 		 387 aa  441  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  58.67 
 
 		 376 aa  428  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  50.66 
 
 		 383 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  47.73 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  48.56 
 
 		 385 aa  363  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  46.79 
 
 		 384 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  48.06 
 
 		 390 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  48.19 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  41.55 
 
 		 375 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1662  aminotransferase, class I and II  42.67 
 
 		 378 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  40.93 
 
 		 391 aa  315  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  45.36 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  42.89 
 
 		 401 aa  300  3e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  39.79 
 
 		 386 aa  295  7e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  41.05 
 
 		 521 aa  291  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  42.09 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  41.51 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  42.53 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  41.09 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  38.6 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  36.87 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  35.43 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  40.51 
 
 		 392 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  36.07 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  42.05 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  36.07 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  36.07 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  36.34 
 
 		 383 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  36.07 
 
 		 383 aa  279  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  36.07 
 
 		 383 aa  279  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  35.81 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  35.81 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  35.81 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  40.67 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  41.88 
 
 		 409 aa  275  9e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  35.73 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  35.73 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  35.73 
 
 		 393 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  37.89 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  42.71 
 
 		 405 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  40.56 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  37.37 
 
 		 393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  37.56 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  38.4 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  37.37 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  39.95 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  37.73 
 
 		 390 aa  259  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  38.5 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  36 
 
 		 372 aa  255  7e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  40 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  36.02 
 
 		 399 aa  252  9.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  38.34 
 
 		 394 aa  252  9.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  34.88 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  35.7 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  40.75 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  37.76 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  37.98 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  37.73 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  35.97 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  37.66 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  39.23 
 
 		 390 aa  242  7e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  34.75 
 
 		 404 aa  242  7.999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  39.06 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  39.06 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  37.3 
 
 		 514 aa  239  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  34.79 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  33.16 
 
 		 390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  32.29 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  32.82 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  35.32 
 
 		 390 aa  233  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  34.35 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  33.86 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  32.65 
 
 		 386 aa  229  7e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 		 391 aa  229  8e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  35.31 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  31.58 
 
 		 387 aa  225  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  34.1 
 
 		 396 aa  223  6e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  33.42 
 
 		 387 aa  222  8e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10930  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  34.32 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34112  unclonable  0.00000000328438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  36.6 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  32.49 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  37.14 
 
 		 414 aa  219  6e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  32.91 
 
 		 390 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28388  predicted protein  38.78 
 
 		 389 aa  217  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0426806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  37.13 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  33.59 
 
 		 392 aa  216  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  31.28 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 		 392 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  34.02 
 
 		 392 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0792  aminotransferase  31.35 
 
 		 396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.108928  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  36.98 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  30.61 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  31.41 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>