More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10930 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_10930  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  100 
 
 
405 aa  847    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34112  unclonable  0.00000000328438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  45.61 
 
 
402 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  44.36 
 
 
402 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  44.36 
 
 
402 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  44.11 
 
 
402 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  44.61 
 
 
402 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  43.53 
 
 
400 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 
401 aa  263  4.999999999999999e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  32.83 
 
 
393 aa  246  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  35.66 
 
 
394 aa  245  8e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  33.08 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  37.22 
 
 
392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  32.09 
 
 
389 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  34.67 
 
 
386 aa  234  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 
386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  36.84 
 
 
393 aa  233  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  31.92 
 
 
383 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  34.32 
 
 
385 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  34.32 
 
 
392 aa  229  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  32.17 
 
 
397 aa  228  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  33.17 
 
 
386 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  33.99 
 
 
409 aa  228  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  36.34 
 
 
385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  32.67 
 
 
386 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  31.16 
 
 
383 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  31.42 
 
 
391 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  35.64 
 
 
385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  31.16 
 
 
383 aa  223  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  31.16 
 
 
383 aa  222  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  32.67 
 
 
393 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  30.9 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  31.16 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  31.91 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  30.65 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  34.06 
 
 
404 aa  220  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  30.9 
 
 
383 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  32.81 
 
 
399 aa  220  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  32.93 
 
 
396 aa  221  3e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  30.9 
 
 
383 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  32.42 
 
 
393 aa  219  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  32.42 
 
 
393 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  34.34 
 
 
521 aa  218  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  31.93 
 
 
397 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  33.17 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  30.65 
 
 
383 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  30.65 
 
 
383 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  34.81 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  34.92 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  34.16 
 
 
387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  31.62 
 
 
388 aa  212  7e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 
383 aa  212  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  32.96 
 
 
387 aa  211  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  33.58 
 
 
372 aa  211  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  32.09 
 
 
400 aa  210  5e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  34.48 
 
 
390 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  33.92 
 
 
394 aa  209  8e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 
387 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  29.21 
 
 
397 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  32.11 
 
 
405 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  34.22 
 
 
390 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  33.17 
 
 
385 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  33.17 
 
 
385 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  30.83 
 
 
393 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  32.75 
 
 
379 aa  204  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  30.42 
 
 
386 aa  203  5e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 
384 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1624  aminotransferase class I and II  32.52 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.514192  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  32.58 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  34.34 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  34.16 
 
 
383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  31.44 
 
 
395 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  29.55 
 
 
393 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  30.38 
 
 
392 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  30.38 
 
 
392 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  29.18 
 
 
393 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  33.6 
 
 
391 aa  193  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  31.58 
 
 
395 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  30 
 
 
390 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  31.14 
 
 
375 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 
412 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  30.99 
 
 
387 aa  191  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0792  aminotransferase  27.66 
 
 
396 aa  189  5.999999999999999e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.108928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  34.88 
 
 
386 aa  189  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  31.27 
 
 
391 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  29.57 
 
 
392 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  30.17 
 
 
394 aa  187  4e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1614  cystathionine beta-lyase  29.98 
 
 
389 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  32.17 
 
 
414 aa  186  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  30.88 
 
 
398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  30.79 
 
 
390 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  30.79 
 
 
390 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  30.79 
 
 
390 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  30.79 
 
 
390 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  30.56 
 
 
400 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  29.88 
 
 
390 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  30.56 
 
 
400 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  30.56 
 
 
400 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  29.88 
 
 
390 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  29.88 
 
 
390 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  29.88 
 
 
390 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>