75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_R0093 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_R0093  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0057  tRNA-Val  97.62 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.700226  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0024  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.415553  normal  0.401158 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0029  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.23403e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0028  tRNA-Val  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.278514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0027  tRNA-Val  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0757548  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0031  tRNA-Val  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.057517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0026  tRNA-Val  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.851542  hitchhiker  0.00348632 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309267  tRNA-Val  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0025  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000411074  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0017  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00199817  normal  0.0150591 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0046  tRNA-Val  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0045  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0046  tRNA-Val  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0046  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000910848  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0014  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0053  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000250607  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0045  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11940  tRNA-Val  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000016484  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0021  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0063  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00355332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  90.24 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0025  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368107  normal  0.0217616 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0014  tRNA-Val  90.24 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.629466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0036  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0051  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000163002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0044  tRNA-Val  90.24 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0052  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0049  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.507561 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0068  tRNA-Val  90 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.064456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0046  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.26227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0059  tRNA-Val  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000382947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0056  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0065  tRNA-Val  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0015  tRNA-Val  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0058257  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0016  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000321371  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0043  tRNA-Val  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000282186  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0041  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000505895  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0052    90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0026  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0015  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000030839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA13  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00601929  normal  0.184013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0020  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0008  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0046  tRNA-Val  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0026  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.218598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0043  tRNA-Val  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0172535  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0041  tRNA-Val  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.424139  normal  0.210105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0033  tRNA-Val  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0003  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0035  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000289059  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0009  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0011  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00527391  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0065  tRNA-Val  91.43 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0059636  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0059  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0012  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000512028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0031  tRNA-Val  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1361  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0046  tRNA-Ala  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.150337  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0059  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0061  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000631723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0010  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20650  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0047  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0035  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0020  tRNA-Val  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0496105  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0022  tRNA-Val  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0013  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0369049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0088  tRNA-Val  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.109488  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0040  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0475845  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263223  normal  0.0193915 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>