37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_R0015 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_R0015  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0058257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0028  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.278514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0027  tRNA-Val  93.15 
 
 		 75 bp  99.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0757548  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0057  tRNA-Val  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.700226  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0023  tRNA-Val  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.885733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0010  tRNA-Val  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.194881 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0040  tRNA-Val  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949801 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0042  tRNA-Val  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206576  normal  0.0624418 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1386  tRNA-Val  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0550643 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0026  tRNA-Val  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.851542  hitchhiker  0.00348632 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0093  tRNA-Val  96.43 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0031  tRNA-Val  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.057517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0063  tRNA-Val  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0014  tRNA-Val  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.629466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0012  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.021618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0018  tRNA-Val  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0032  tRNA-Val  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000020219  hitchhiker  8.04575e-18 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1385  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0561605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0024  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.415553  normal  0.401158 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0025  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368107  normal  0.0217616 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11940  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000016484  normal  0.0993064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0013  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0036  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0054  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0048  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.884933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0046  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.146675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0016  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0029  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.23403e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0028  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.13979  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0014  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0027  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000730329  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0008  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000957098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0050  tRNA-Val  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309212  tRNA-Val  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.430818  normal  0.748874 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t06  tRNA-Val  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0024  tRNA-Val  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>