63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0059 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_R0059  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000382947  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0053  tRNA-Val  95.65 
 
 
75 bp  113  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000250607  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0045  tRNA-Val  94.2 
 
 
75 bp  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0045  tRNA-Val  94.2 
 
 
75 bp  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0046  tRNA-Val  94.2 
 
 
75 bp  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000910848  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0043  tRNA-Val  91.3 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000282186  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0065  tRNA-Val  91.3 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0059636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0039  tRNA-Val  91.07 
 
 
72 bp  71.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00107403  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0047  tRNA-Val  91.07 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00873766  hitchhiker  0.00896999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0043  tRNA-Val  91.07 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0177605  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0040  tRNA-Val  91.07 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288253  hitchhiker  0.000507453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0021  tRNA-Val  90.74 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0036  tRNA-Val  90.74 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258762  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-3  tRNA-Val  89.47 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0029  tRNA-Val  97.3 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0021  tRNA-Val  97.22 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0063  tRNA-Val  86.76 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00355332  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  90.2 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14034  tRNA-Val  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622318  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0026  tRNA-Val  88.89 
 
 
72 bp  60  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0265977  hitchhiker  0.000432959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0046  tRNA-Val  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467185  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0014  tRNA-Val  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0018  tRNA-Val  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0014  tRNA-Val  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591193  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0008  tRNA-Val  92.86 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153849  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0015  tRNA-Val  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  88.89 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0043  tRNA-Val  89.8 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000221825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0043  tRNA-Val  89.8 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.174816  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0041  tRNA-Val  94.44 
 
 
72 bp  56  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000505895  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0057  tRNA-Val  94.44 
 
 
75 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.700226  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0022  tRNA-Val  84 
 
 
75 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0029  tRNA-Val  88.89 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.575368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0028  tRNA-Val  88.89 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0026  tRNA-Val  88.89 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0031  tRNA-Val  85.96 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432364  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0041  tRNA-Val  90.24 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.424139  normal  0.210105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0027  tRNA-Val  88.89 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.60657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0029  tRNA-Val  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0245746  normal  0.0651884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0093  tRNA-Val  96.43 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07210  tRNA-Val  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.87743 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09530  tRNA-Val  87.5 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0129641  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0033  tRNA-Val  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523176  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0047  tRNA-Val  85.71 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0016  tRNA-Val  84.75 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000321371  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0014  tRNA-Val  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0029  tRNA-Val  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.23403e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0024  tRNA-Val  85.45 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.415553  normal  0.401158 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Val-1  tRNA-Val  88.1 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0049359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  85.19 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  85.19 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0021  tRNA-Val  88.1 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0144657  normal  0.36354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0020  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000127781  normal  0.601367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0046  tRNA-Val  85.19 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0191389  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0044  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0045  tRNA-Val  88.1 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.218137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0041  tRNA-Val  84.48 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0026  tRNA-Val  84.48 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113953  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0042  tRNA-Val  88.1 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288324  hitchhiker  0.00194275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0065  tRNA-Val  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2615  tRNA-Val  88.1 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.71269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>